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标题: 一个大概240个原子二聚体分子的基态优化，出现了Bend failed for angle错误 [打印本页]

作者
Author: qeheikj 时间: 2025-7-15 11:11
标题: 一个大概240个原子二聚体分子的基态优化，出现了Bend failed for angle错误
首先我使用b3lyp/6-311g(d)进行优化，出现了Bend failed for angle 180 - 194 - 193错误，也就是这几个原子成直线了。然后尝试用笛卡尔坐标（opt=cartesian）继续优化。然后还是优化不收敛，但是似乎应经到了一个极小点。下面贴出路径图
我可以尝试增大收敛极限，或者opt=(cartesian,gdiis)继续优化吗？或者有没有什么好的方法可以收敛

作者
Author: 我本是个娃娃 时间: 2025-7-15 14:17
没有结构，很难给出具体建议。因此这里给出一些大体上的建议。
一，240个原子的体系有一点大，用DFT有些吃力，所以建议使用Semi-empirical的方法优化。比如XTB。
二。使用B3LYP-D3(BJ)方法，同时，有二聚作用的原子使用6-311G(d)，其余原子用6-31(d)。

作者
Author: qeheikj 时间: 2025-7-15 15:26

我本是个娃娃发表于 2025-7-15 14:17
没有结构，很难给出具体建议。因此这里给出一些大体上的建议。
一，240个原子的体系有一点大，用DFT有些吃 ...

好的，我尝试一下。这是结构

作者
Author: 我本是个娃娃 时间: 2025-7-15 15:42

qeheikj 发表于 2025-7-15 15:26
好的，我尝试一下。这是结构

这个二聚体系有很明显的Pi-Pi stocking，必须加D3 correction

作者
Author: qeheikj 时间: 2025-7-15 16:14

我本是个娃娃发表于 2025-7-15 15:42
这个二聚体系有很明显的Pi-Pi stocking，必须加D3 correction

是的，是加了色散矫正的

作者
Author: qeheikj 时间: 2025-7-15 16:30

我本是个娃娃发表于 2025-7-15 15:42
这个二聚体系有很明显的Pi-Pi stocking，必须加D3 correction

还有就是您提出来的第二种方法，是用onion模型吧？那确定π-π作用原子的话，用Mercury确定到具体原子吗，还是环？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-7-16 11:38
当前帖子和“量化理论”无直接联系，看清楚本版块版头的分类说明什么样的话题才适合选择“量化理论”，勿随便选择“量化理论”分类。这次给你改了，以后注意

如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “一个二聚体分子的基态优化，大概240个原子” 改了，以后务必注意！

作者
Author: sobereva 时间: 2025-7-16 11:40

qeheikj 发表于 2025-7-15 16:30
还有就是您提出来的第二种方法，是用onion模型吧？那确定π-π作用原子的话，用Mercury确定到具体原子吗 ...

那叫ONIOM。当前没必要用
PM6D3做预优化，然后B3LYP-D3(BJ)/6-31G*进一步优化
几何优化不收敛问题老生常谈，仔细看
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164

加了D3的时候提问的时候必须主动交代，下文明确说了
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298（http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html）

还老有人计算时明明带了DFT-D3校正，提问时居然不说，只说泛函原本名字，等我强调必须加DFT-D3时，对方才说已经加了DFT-D3，这极其令我愤怒！加不加色散校正根本就不是同样的理论方法，而且很多情况对结果影响巨大，这么重要的事怎么能不在提问时强调！？诸如你实际计算用了PBE结合DFT-D3(BJ)，就必须在提问时说用的是PBE-D3(BJ)！

作者
Author: qeheikj 时间: 2025-7-16 14:57

sobereva 发表于 2025-7-16 11:40
那叫ONIOM。当前没必要用
PM6D3做预优化，然后B3LYP-D3(BJ)/6-31G*进一步优化
几何优化不收敛问题老生 ...

好的，抱歉，下次描述精准。

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