计算化学公社

标题: gromacs计算氢键的时候，显示小分子没有氢键供体受体，这是什么情况呢 [打印本页]

作者
Author: hugromacs 时间: 2025-7-18 01:50
标题: gromacs计算氢键的时候，显示小分子没有氢键供体受体，这是什么情况呢
但是对接的时候明明是有氢键相互作用的，而且不可能没有氢键的，想问一下大家有没有遇到这种情况呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-7-18 07:16
没输入文件没法判断情况
O/N-H默认作为氢键给体，N、O默认作为氢键受体。如果tpr文件里没能正确体现这点就没法判断出来

作者
Author: 日月崇光 时间: 2025-7-18 14:50
gmx hbond偶尔会遇到这个问题，可以用gmx hbond-legacy

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)