计算化学公社

标题: 模拟nvt过程中，所设的截断值发生改变 [打印本页]

作者
Author: huangzi 时间: 2025-7-26 22:17
标题: 模拟nvt过程中，所设的截断值发生改变
老师们，我模拟li在聚合物固态电解质传输体系，含有18880个原子，然后盒子大小24*24*24，在能量最小化过程结束后，进行nvt弛豫，截断值在nvt.mdp我设置的是1.2nm,但刚开始模拟就出现图中情况，截断半径成为1.875nm，想问问我哪方面设置不太合理？

作者
Author: KazusaT 时间: 2025-7-27 05:03
mdrun命令有一个选项tunepme，会自动优化傅立叶变换格点数和截断半径来平衡负载，具体的可以看看手册
-[no]tunepme (yes)

Optimize PME load between PP/PME ranks or GPU/CPU

作者
Author: sobereva 时间: 2025-7-28 01:16
没有什么不合适的。gromacs自动给你改成了计算效率最高的cutoff，这不会影响静电作用的计算精度

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)