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标题: 用什么软件对已有的蛋白质结构进行调整 [打印本页]

作者
Author: realcheryl 时间: 2025-7-28 12:11
标题: 用什么软件对已有的蛋白质结构进行调整
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请问一下怎么对从UniProt上下载的蛋白质结构上的某些氨基酸进行结构调整，类似接上一个基团或者替换掉一个基团，PyMol可以识别氨基酸但不知道是否可以处理，MS可以处理但是没法识别氨基酸。有哪个软件可以识别氨基酸并调整原子种类、数目和结构吗？

作者
Author: student0618 时间: 2025-7-28 12:19
PyMOL可以。wizard mutagenesis换胺基酸，builder可以用来加functional group及换原子。

作者
Author: realcheryl 时间: 2025-7-28 12:40

student0618 发表于 2025-7-28 12:19
PyMOL可以。wizard mutagenesis换胺基酸，builder可以用来加functional group及换原子。

太感谢您啦，PyMol可以的话就方便很多了，但是我还不太会用PyMol，很多功能都不知道怎么使用，请问PyMol的操作有什么教程可以学习吗。

作者
Author: student0618 时间: 2025-7-28 14:16
个人认为自己先摸索一下尝试所有按钮比很多教程都有用，特定功能的用法可以搜PyMOL Wiki (https://pymolwiki.org)

例如Mutagenesis 示例：https://pymolwiki.org/index.php/Mutagenesis

builder示例：https://pymolwiki.org/index.php/Builder

作者
Author: realcheryl 时间: 2025-7-28 15:18

student0618 发表于 2025-7-28 14:16
个人认为自己先摸索一下尝试所有按钮比很多教程都有用，特定功能的用法可以搜PyMOL Wiki (https://pymolwik ...

好的，太感谢啦！

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