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标题: 亲水孔道中水分子自发排出是什么原因? [打印本页]

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雷阵雨    时间: 2025-8-6 22:14
标题: 亲水孔道中水分子自发排出是什么原因?
本帖最后由 雷阵雨 于 2025-8-6 22:41 编辑

如题,我最近做了一个关于水分子+1nm孔道的亲水多孔SiO2的模拟,一开始在孔道和骨架两侧分别gmx solvate填充水。其中水分子用的是OPC模型,多孔硅骨架的参数用的是修正后的Chem. Mater., 26, 2647 (2014)中SiO2的参数。分别尝试了NVT和NPT模型,但是在模拟过程中均出现了水分子从孔道中排出的情况,请问各位老师这是合理的现象吗?之前看文献中关于微孔中水的分布的讨论,疏水孔是会有自发脱水的情况,亲水孔自发脱水的报道好像很少,且之前看到文献中用实验手段表征到了亲水孔道中水分子的存在,故提出这个疑问,请各位老师不吝赐教。



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sobereva    时间: 7 day ago
检查原子电荷。若原子电荷不当,静电相互作用不足,自然会排除出来
记住问这种问题必须给出拓扑文件,光给个mdp毫无用处,这完全不体现力场信息
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雷阵雨    时间: 7 day ago
谢谢sob老师,opc水和材料的拓扑文件如下,材料的拓扑文件较大没法上传,故仅把sobtop中相关原子的参数上传了




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