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标题: gmx模拟稀疏填充的盒子，能通过控温获得实际密度吗？ [打印本页]

作者
Author: Novice 时间: yesterday 11:25
标题: gmx模拟稀疏填充的盒子，能通过控温获得实际密度吗？
本帖最后由 Novice 于 2025-8-11 19:20 编辑

如题，我模拟了一个稀疏填充的周期盒子，填充密度约为实际密度的1/10。nvt模拟后发现体系变为团簇聚集的结构；采用npt继续模拟发现盒子体积在缓慢变小。请问如果继续模拟下去体系能变为接近真实密度的情况吗？模拟时长需要多久呢？
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体系举例，比如社长的gmx培训班有个纳米水滴的气化模拟例子，后面还进行了降温使水蒸气冷凝，但是这两个过程中用的均是NVT模拟，我想问对于后面水的冷却，能通过NPT模拟在可以接受的时间尺度（比如10ns）将体系变为一个完全液体水填充满的盒子吗？

作者
Author: sobereva 时间: yesterday 21:12
可以。需要多久取决于压浴设置
把tau_p设小、可压缩系数设大，都可以加快盒子尺寸的变化

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