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标题: 请教LAMMPS轨迹在VMD中分子显示不完整的问题 [打印本页]

作者
Author: qingqingBANG 时间: 前天 16:37
标题: 请教LAMMPS轨迹在VMD中分子显示不完整的问题
老师好，经DeepMD + LAMMPS 产生了dump文件，并采用ovito输出xyz文件。目前想要使用VMD查看轨迹中分子的动态情况，一开始导入出现结构混乱后采用Dynamic Bonds显示，但是发现一部分帧会出现分子缺失的情况(检查xyz文件中原子数正常），问题：如何解决这种分子显示不完整的情况
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作者
Author: sarphuart 时间: 前天 17:06
http://bbs.keinsci.com/thread-20047-1-1.html

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 前天 19:08
这是我看到的第三个以为LAMMPS无法直接输出VMD支持查看的轨迹文件、非要绕远路转换格式的情况了，我实在不理解为什么。看http://bbs.keinsci.com/thread-54542-1-1.html我的回复。

作者
Author: qingqingBANG 时间: yesterday 14:50

sarphuart 发表于 2025-8-13 17:06
http://bbs.keinsci.com/thread-20047-1-1.html

好的，谢谢老师

作者
Author: qingqingBANG 时间: yesterday 14:50

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-8-13 19:08
这是我看到的第三个以为LAMMPS无法直接输出VMD支持查看的轨迹文件、非要绕远路转换格式的情况了，我实在不 ...

好的，谢谢老师，已解决

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