各位老师好,我想构建一个磷脂双分子层来跑MD,后续也会进一步插入一些分子,目前我用到的磷脂分子是PSPG(见下图),我想寻找这个磷脂的力场参数,但是没有找到,目前
(1)在https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.jctc.1c01217中拟合了用于用于amber的Lipid21力场,里面包含了DSPG,但他是适合amber力场的,没接触过amber,有点难看懂,请问有办法将这个参数转变成适合gromacs的拓扑文件么?
(2)如果不采用文献的参数,我使用soptob产生这个分子的参数,然后构建双层膜跑md,可行么这样的方法是否可行呢?
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