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标题: orca用ESD算磷光光谱ORCA finished by error termination in CIS报错 [打印本页]

作者
Author: 陈AG 时间: 2025-8-20 15:36
标题: orca用ESD算磷光光谱ORCA finished by error termination in CIS报错
本帖最后由陈AG 于 2025-8-20 17:11 编辑

请问各位老师，我在用orca5.0.3算磷光光谱的时候，出现了一下报错，查看了相关帖子，还是解决不了，请给位老师解惑。
最后输出如下：<<Displacing mode 115 (+)>>

ORCA finished by error termination in CIS
Calling Command: mpirun -np 10  /home/server023/programs/orca/5.0.4/orca_cis_mpi ESD-Phos-CHS.cisinp.tmp ESD-Phos-CHS >ESD-Phos-CHS.lastcis
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 465]:
  .... aborting the run

Timings for individual modules:

Sum of individual times       ...  1277473.445 sec (=21291.224 min)
GTO integral calculation       ...       7.140 sec (= 0.119 min) 0.0 %
Relativistic integrals       ...    89.821 sec (= 1.497 min) 0.0 %
SCF iterations                ...    1374.189 sec (=  22.903 min) 0.1 %
CIS module                   ...    5682.820 sec (=  94.714 min) 0.4 %
ESD module                   ...  1270319.475 sec (=21171.991 min)  99.4 %
                           ****ORCA TERMINATED NORMALLY****
TOTAL RUN TIME: 14 days 18 hours 51 minutes 19 seconds 413 msec

内存部分显示也没有超：                   ****Iteration 0****

Memory handling for direct AO based RPA:
Memory per vector needed    ... 116 MB
Memory needed                ...  6980 MB
Memory available             ... 20000 MB

****Iteration 0****
            <<< Triplet sigma vectors requested >>>

Memory handling for direct AO based RPA:
Memory per vector needed    ... 87 MB
Memory needed                ...  5236 MB
Memory available             ... 20000 MB

(, 下载次数 Times of downloads: 8) (, 下载次数 Times of downloads: 3)

作者
Author: zjxitcc 时间: 2025-8-20 16:28
看输出文件似乎是ORCA使用数值导数方式计算跃迁偶极矩导数，产生了115个微扰的几何结构，在其中某一个结构的计算中发生了问题，你看看其他文本文件中有没有报错信息，例如第115个结构是否SCF不收敛、TDDFT激发振幅迭代不收敛之类的。

作者
Author: 陈AG 时间: 2025-8-20 17:13

zjxitcc 发表于 2025-8-20 16:28
看输出文件似乎是ORCA使用数值导数方式计算跃迁偶极矩导数，产生了115个微扰的几何结构，在其中某一个结构 ...

老师,其他文本文件压缩上传了,其中ESD-Phos-CHS_property.txt里面有116个SCF信息,但是好像没有什么问题
SCF_Energy
description: The SCF energy
geom. index: 26
prop. index: 1
      SCF Energy: -20545.2735450177
# -----------------------------------------------------------
$ DFT_Energy
description: The DFT energy
geom. index: 26
prop. index: 1
Number of Alpha Electrons             224.0001476432
Number of Beta  Electrons             224.0001476432
Total number of  Electrons             448.0002952864
Exchange energy                      -491.9133616914
Correlation energy                      -17.2308529074
Correlation energy NL                   0.0000000000
Exchange-Correlation energy          -509.1442145988
Embedding correction                      0.0000000000
Total DFT Energy (No VdW correction)  -20545.2735450177

作者
Author: wzkchem5 时间: 2025-8-20 20:30

陈AG 发表于 2025-8-20 17:13
老师,其他文本文件压缩上传了,其中ESD-Phos-CHS_property.txt里面有116个SCF信息,但是好像没有什么问题
...

文件ESD-Phos-CHS.lastcis是否存在，如果存在，内容是什么？结尾是否有报错信息？

作者
Author: 陈AG 时间: 2025-8-21 08:41

wzkchem5 发表于 2025-8-20 20:30
文件ESD-Phos-CHS.lastcis是否存在，如果存在，内容是什么？结尾是否有报错信息？

老师，没有您说的这个文件

作者
Author: wzkchem5 时间: 2025-8-21 08:54

陈AG 发表于 2025-8-21 08:41
老师，没有您说的这个文件

那可能最简单的方法是重新跑一遍，可能是偶然的硬件问题导致的计算报错

作者
Author: 陈AG 时间: 2025-8-21 09:00
本帖最后由陈AG 于 2025-8-21 09:02 编辑

wzkchem5 发表于 2025-8-21 08:54
那可能最简单的方法是重新跑一遍，可能是偶然的硬件问题导致的计算报错

老师，这个有没有续算的呀，我这个跑了十几天

ps：会不会是我昨天开了很多个orca任务（算soc），所以资源利用上有什么冲突了

作者
Author: wzkchem5 时间: 2025-8-21 09:03

陈AG 发表于 2025-8-21 09:00
老师，这个有没有续算的呀，我这个跑了十几天
ps：会不会是我昨天开了很多个orca任务（算soc），所 ...

有可能，比如内存爆了，或者硬盘爆了，或者不同任务的临时文件冲突了
只有SCF部分可以续算

作者
Author: 陈AG 时间: 2025-8-21 09:06

wzkchem5 发表于 2025-8-21 09:03
有可能，比如内存爆了，或者硬盘爆了，或者不同任务的临时文件冲突了
只有SCF部分可以续算

好吧，谢谢老师

作者
Author: 陈AG 时间: 2025-8-21 09:10

wzkchem5 发表于 2025-8-21 09:03
有可能，比如内存爆了，或者硬盘爆了，或者不同任务的临时文件冲突了
只有SCF部分可以续算

Primary job terminated normally, but 1 process returned
a non-zero exit code. Per user-direction, the job has been aborted.
--------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 9 with PID 0 on node server023 exited on signal 9 (Killed).
--------------------------------------------------------------------------
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 465]:
.... aborting the run
老师，终端还输出了这个，我去找了一下相关的帖子，应该是同时开太多orca任务了，内存爆了

作者
Author: 陈AG 时间: 2025-11-19 16:34

wzkchem5 发表于 2025-8-21 09:03
有可能，比如内存爆了，或者硬盘爆了，或者不同任务的临时文件冲突了
只有SCF部分可以续算

王老师，为什么我算完，用spectrum作图不是光谱形状啊
! PBE0 DKH2 DKH-def2-TZVP(-f) SARC/J RIJCOSX tightSCF CPCM(toluene) ESD(PHOSP) miniprint
%maxcore  2000
%pal nprocs 30 end
%basis
NewGTO Pt "SARC-DKH-TZVP" end
end
%scf
ConvForced true
end
%TDDFT
NROOTS 5
DOSOC  TRUE
TDA FALSE
IROOT 1
   TRIPLETS TRUE
END
%ESD
GSHESSIAN "/data/3.AG-Pt-B/AG-Pt-B013/orca/orca-C/S0-OPT-FREQ.hess"
TSHESSIAN "/data/3.AG-Pt-B/AG-Pt-B013/orca/orca-C/T1-OPT-FREQ.hess"
DOHT TRUE
DELE 22120.51631
LINES  VOIGT
LINEW  75
INLINEW  200
END
* XYZFILE 0 1 /data/3.AG-Pt-B/AG-Pt-B013/orca/orca-C/S0-OPT-FREQ.xyz

作者
Author: wzkchem5 时间: 2025-11-19 17:40

陈AG 发表于 2025-11-19 16:34
王老师，为什么我算完，用spectrum作图不是光谱形状啊
! PBE0 DKH2 DKH-def2-TZVP(-f) SARC/J RIJCOSX t ...

什么叫“不是光谱形状”？用没有歧义的语言描述

作者
Author: 陈AG 时间: 2025-11-20 08:39

wzkchem5 发表于 2025-11-19 17:40
什么叫“不是光谱形状”？用没有歧义的语言描述

老师，就是作图做出来不是正常磷光光谱的样子，是我的输入哪里有问题吗

作者
Author: wzkchem5 时间: 2025-11-20 12:49

陈AG 发表于 2025-11-20 08:39
老师，就是作图做出来不是正常磷光光谱的样子，是我的输入哪里有问题吗

用tcutfreq去掉较低频的振动（一般去掉100cm-1以下的），再试。具体方法在手册里搜tcutfreq

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