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标题: 我用extrema.pqr和vtx.pqr画静电势的流程对不对 [打印本页]

作者
Author: yancaoshu 时间: 2025-8-22 11:42
标题: 我用extrema.pqr和vtx.pqr画静电势的流程对不对
本帖最后由 yancaoshu 于 2025-8-22 14:23 编辑

大家好，我是新手，想让作者大大看看我的流程对不对。
我算的是小分子，用VASP作弛豫和静态计算，随后使用Multiwfn LOCPOT得到LOCPOT.cub文件，然后Multiwfn LOCPOT.cub得到extrema.pqr和vtx.pqr文件,如附件所示。
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将LOCPOT.cub，extrema.pqr和vtx.pqr导入vmd软件中。设置完毕后如图结果图所示。
(, 下载次数 Times of downloads: 5)
现在有一个问题是:
vtx.pqr里面的color scale data range设置为20到48（vtx.pqr文件里都是正数，范围是22到52）
这样我画color bar的时候应该写20-48还是-20-48呢？
这样画图的流程到底对不对。还请大家帮忙解答一下。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-8-23 12:29
算小分子用VASP纯粹是自找不快，用什么不好非要用极其不适合算小分子的VASP，没有Gaussian也可以用免费的ORCA结合Multiwfn做静电势分析

作者
Author: yancaoshu 时间: 2025-8-25 10:04
Gaussian实在是不太熟练

只会vasp了

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