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标题: sobEDA.sh遇见报错 [打印本页]

作者
Author: luoxuping 时间: 2025-8-29 14:16
标题: sobEDA.sh遇见报错
Linux目录下有以下文件template.gjf，fragment.txt，sobEDA.sh，system.xyz
机子中有Gaussian16和gaussian09两个
.bashrc中的gaussian路径的g09的，因为平时都是用g09算东西，
因为sobEDA.sh要使用g16所以在sobEDA.sh加入了以下三行

export GAUSS_EXEDIR="/home/mcpe/apps/gau_lin_64/g16c02"
export PATH="/home/mcpe/apps/gau_lin_64/g16c02":$PATH
export GAUSS_SCRDIR="~/tmp/sobeda_1"
最后在xshell中输入./sobEDA.sh |tee result.txt
发现报错如下
Number of fragments: 2

Charge and spin multiplicity of fragment 1: 0 1
Indices of atoms in fragment 1: 1-49,67-76
Generating Gaussian input file of fragment 1 via Multiwfn (fragment1.gjf)
Running: g16 < fragment1.gjf &> fragment1.out
./sobEDA.sh: line 127: 44145 Aborted (core dumped) $gau < fragment$i.gjf &>fragment$i.out
Error encountered, please check corresponding output file! Now script exits

这是为什么

作者
Author: sobereva 时间: 2025-8-29 17:05
使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
http://sobereva.com/685（http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html）

按照文中的“sobEDA.sh运行中途出错或结果明显异常怎么办？”部分所述依次排查

作者
Author: luoxuping 时间: 2025-8-30 13:56
好的好的

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)