计算化学公社

标题: 求助CP2K优化Fe2O3的slab模型,结果扭曲 [打印本页]

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2429783189    时间: 2025-8-31 00:43
标题: 求助CP2K优化Fe2O3的slab模型,结果扭曲
各位老师,我在进行Fe2O3的表面计算,使用slab模型,由于Fe2O3的收敛较为困难,我照搬了CP2K培训班中的的Fe2O3电子组态初猜,我的设置如下图(输入文件详情可见附件中Fe2O3.inp) (, 下载次数 Times of downloads: 0) ,我对Fe的片段划分如下图(片段划分详情可见附件中的fragment.gjf,可打开Tools-Atom Groups查看) (, 下载次数 Times of downloads: 0) ,这一切做法都参考了讲义内容,初期的收敛较为顺利(输出文件详情可见附件中的Fe2O3.out),但是优化过程中出现较大扭曲,甚至好像还有Fe原子跑出盒子外,下图分别为初始结构和最终收敛结构(优化过程详情可见附件中的Fe2O3-pos.xyz) (, 下载次数 Times of downloads: 0) (, 下载次数 Times of downloads: 0) 我的初猜结构来自Material Project的Conventional Standard(https://legacy.materialsproject.org/materials/mp-24972/),对角化算法和smearing和DFT+U都试过了,都无法解决问题,甚至收敛变困难许多。截断能应该是较为合适的值(尝试调大到800会令收敛变慢)。所有的相关文件已上传于附件Fe2O3.zip,想请问一下老师如何解决这一问题呢?

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sobereva    时间: 2025-8-31 08:11
尝试slab取得更厚,并且冻结底部原子
并且要求优化过程中产生自旋密度cube文件,取其中的几步检查自旋密度分布是否满足期望
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2429783189    时间: 2025-8-31 23:53
本帖最后由 2429783189 于 2025-9-1 00:12 编辑
sobereva 发表于 2025-8-31 08:11
尝试slab取得更厚,并且冻结底部原子
并且要求优化过程中产生自旋密度cube文件,取其中的几步检查自旋密度 ...

感谢老师!尝试了一下冻结底部原子解决了,9步优化成功。此外追问老师一个问题,我的另一个对比体系是MnO2,主要比较两者表面吸附有机分子的吸附位点,吸附能和成键,MnO2体系在优化过程中一切正常,为了保持两个体系的可比性,是否有绝对必要也冻结MnO2底部的原子呢?
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sobereva    时间: 2025-9-1 06:56
2429783189 发表于 2025-8-31 23:53
感谢老师!尝试了一下冻结底部原子解决了,9步优化成功。此外追问老师一个问题,我的另一个对比体系是MnO ...

这不在于是否有可比性,关键是用slab模型时做冻结本来就是标准做法,无论是否发现变形,计算时默认就该冻结
如果你发现MnO2的基底没怎么变形,比倒是可以直接比

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2429783189    时间: 2025-9-2 10:30
sobereva 发表于 2025-9-1 06:56
这不在于是否有可比性,关键是用slab模型时做冻结本来就是标准做法,无论是否发现变形,计算时默认就该冻 ...

好的,感谢老师的解答。




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