计算化学公社

标题: 使用VMD作IGMH等值面图的反光问题求助 [打印本页]

作者
Author: wocaishiniu 时间: 2025-9-3 15:29
标题: 使用VMD作IGMH等值面图的反光问题求助
在用VMD做IGMH等值面时，绿色的等值面和原子放大看都有反光如图1，但是过了一段时间重新做的时候就没有反光了如图2，调试了很久也不知道什么原因，完全按照文章中的方法做的，求助各位大神帮忙答疑解惑，万分感谢

http://sobereva.com/621 [size=1.4em]使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-9-3 15:57
有这种清晰反光的材质的Mirror属性大于0，VMD内置材质中只有RTChrome会这样，可以在Graphics - Materials窗口查看。（这和Opacity属性大于0的材质产生的阴影是两回事。）我记得是需要Tachyon渲染来产生的效果，靠Snapshot截屏就没有。

作者
Author: wocaishiniu 时间: 2025-9-3 16:55

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-9-3 15:57
有这种清晰反光的材质的Mirror属性大于0，VMD内置材质中只有RTChrome会这样，可以在Graphics - Materials窗 ...

我是按照做HOMO-LUMO那个方法做的

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-9-3 17:26

wocaishiniu 发表于 2025-9-3 16:55
我是按照做HOMO-LUMO那个方法做的

我不知道你说的是社长或者其他人介绍的哪个方法，用的材质是VMD内置的还是自定义的，“过了一段时间”涉及哪些VMD运行环境或者脚本使用的变动，以及这个反光效果究竟是否需要……这样问问题就算是在原始帖子底下也不容易回答，所以我只能泛泛而谈。我不建议把VMD以及论坛上一大堆脚本当黑箱用，稍微花点时间玩一玩软件读一读手册就能弄清楚很多问题。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-9-4 07:57

wocaishiniu 发表于 2025-9-3 16:55
我是按照做HOMO-LUMO那个方法做的

认真看此文，描述情况必须精确，不得含糊其辞
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚、完整
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

自己添加一堆乱七八糟多余的步骤，只会把情况搞复杂，本来下文就没有你说的这个步骤
使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用
http://sobereva.com/621（http://bbs.keinsci.com/thread-28147-1-1.html）

你用的显示分子结构的材质明显是用的下文的做法，而下文又根本不直接牵扯绘制IGMH（而且此文的做法又不仅仅牵扯到HOMO、LUMO，而是可以绘制任意轨道，你的描述明显有误导性）
用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法（含演示视频）
http://sobereva.com/449（http://bbs.keinsci.com/thread-11550-1-1.html）

显然问问题的时候必须把全部流程严谨地描述出来，否则谁知道你到底都具体做了什么，不可能准确回答

我当前能告诉你的是，把当前用的显示等值面的材质的mirror设成0就不可能出现那种镜像效果

并且注意以后发帖时候帖子标题要尽可能具体，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你不恰当的标题“使用VMD作图求助”改了，以后注意！

作者
Author: wocaishiniu 时间: 2025-9-4 11:01

sobereva 发表于 2025-9-4 07:57
认真看此文，描述情况必须精确，不得含糊其辞
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体 ...

好的，谢谢社长，麻烦了，以后注意

作者
Author: wocaishiniu 时间: 2025-9-4 11:06

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-9-3 17:26
我不知道你说的是社长或者其他人介绍的哪个方法，用的材质是VMD内置的还是自定义的，“过了一段时间”涉 ...

怪我没描述清楚，其实我是想要这个镜面反射的。整个步骤是先按照社长发的IGMH分析文章中的步骤操作，然后打开分子的颜色是根据社长发的设置轨道等值面图的方法做的，就是从VMDrender.txt复制的命令，最后保存渲染也都是安装步骤一步步做的。第一个有镜面的是三个月前做的，后面没镜面的是这几天做的。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)