计算化学公社

标题: 关于不同时刻分子密度统计的命令求助 [打印本页]

作者
Author: 芝士石油 时间: 2025-9-9 15:25
标题: 关于不同时刻分子密度统计的命令求助
各位老师好。我用gmx跑了10ns的NEMD，想统计各类分子在不同时刻的数量密度分布，以2ns时刻为例。
1. 我应该提取0-2ns的轨迹统计平均数量密度分布，还是只提取2ns这一帧的轨迹统计数量密度分布呢？
2. 提取0-2ns的轨迹以分析平均密度分布是否无法反映2ns这一时刻真实的密度分布呢？
3. 但我看之前的帖子有老师说，单独一帧的数密度曲线是离散的，而且也没实际意义，这该如何理解呢？

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)