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标题: 使用计算站计算MD,出现ABORT in start/cp2k.F:122 CPASSERT failed问题 [打印本页]

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KaZikl    时间: 2025-9-10 20:11
标题: 使用计算站计算MD,出现ABORT in start/cp2k.F:122 CPASSERT failed问题
各位老师好,我使用的是CP2K-2023.1这一版本,计算251原子的熔盐分子动力学,在使用计算站时出现了ABORT in start/cp2k.F:122 CPASSERT failed问题,错误文件我已使用txt文件标出,输入文件为EQ1.inp,请问我还有什么需要补充的吗
计算站中我使用的命令为:
#!/bin/bash
#SBATCH -N 1
#SBATCH -n 64
#SBATCH -p amd_256
source /public1/soft/modules/module.sh
module purge
module load gcc/7.3.0-wzm
source /public1/home/scb8444/software-scb8444/cp2k-2023.1/tools/toolchain/install/setup
export PATH=/public1/home/scb8444/software-scb8444/cp2k-2023.1/exe/local:$PATH
export CP2K_DATA_DIR=/public1/home/scb8444/software-scb8444/cp2k-2023.1/data
# export OMP_NUM_THREADS=1
module load mpi/intel/18.0.2-thc
mpirun -np 64 cp2k.popt -i $1 -o $2
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Stardust0831    时间: 2025-9-11 00:26
我这边能正常跑,说明输入文件本身没问题:
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怀疑是cp2k安装问题,或者执行方式有问题。你似乎是想用cp2k.popt,实际却是cp2k.psmp被调用,请检查一下这个问题。

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KaZikl    时间: 2025-9-11 09:40
Stardust0831 发表于 2025-9-11 00:26
我这边能正常跑,说明输入文件本身没问题:

谢谢老师!我再试试
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KaZikl    时间: 2025-9-11 13:24
Stardust0831 发表于 2025-9-11 00:26
我这边能正常跑,说明输入文件本身没问题:

老师,您知道为什么进行到初猜这个计算就进行不下去的原因嘛,依然是这个体系和输入文件,进行到初猜之后就不再输出了
作者
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Stardust0831    时间: 2025-9-11 15:23
KaZikl 发表于 2025-9-11 13:24
老师,您知道为什么进行到初猜这个计算就进行不下去的原因嘛,依然是这个体系和输入文件,进行到初猜之后 ...

检查cp2k安装问题,优先考虑用cp2k的popt版本。你报错显示现在可能是在用psmp版本




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