计算化学公社
标题:
求助:关于TraPPE力场和GAFF力场的兼容性问题
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作者Author:
Lisy
时间:
2025-9-11 09:44
标题:
求助:关于TraPPE力场和GAFF力场的兼容性问题
请问各位老师,请问TraPPE力场和GAFF力场兼容吗,我想用gromacs模拟有机小分子+超临界二氧化碳的混合体系,我能二氧化碳用TraPPE力场,有机小分子用GAFF力场吗?
作者Author:
maxuexuehuahua
时间:
2025-9-11 10:17
我之前改过,用的
http://sobereva.com/soft/Sobtop/
,我觉得可以
作者Author:
Lisy
时间:
2025-9-11 10:31
maxuexuehuahua 发表于 2025-9-11 10:17
我之前改过,用的http://sobereva.com/soft/Sobtop/,我觉得可以
二氧化碳的力场直接用TrappE和sobtop产生的小分子的GAFF混用吗?还是需要做什么修改?方便提供下您的二氧化碳力场文件吗,谢谢您!
作者Author:
maxuexuehuahua
时间:
2025-9-11 10:38
我做的不是CO2,用的甲烷,直接定义CO2的力场参数和命名就行了,你可以看看里面的例子
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