计算化学公社

标题: 求助:关于CP2K轨迹的保存 [打印本页]

作者
Author:
Lisy    时间: 2025-9-13 19:31
标题: 求助:关于CP2K轨迹的保存
我用CP2K跑AIMD跑了几千步,但是整个文件太大了,我只想存出最后的几百帧在VMD里查看,请问如何只选取轨迹的最后几百帧单独保存出来呢?

作者
Author:
sobereva    时间: 2025-9-14 02:31
VMD载入轨迹,save coordinate的地方恰当输入要保存的帧号范围。如果之前不是dcd格式,建议保存成dcd,文件格式紧凑因此记录相同内容比xyz和pdb小得多,而且记录盒子信息
作者
Author:
Lisy    时间: 2025-9-14 12:54
sobereva 发表于 2025-9-14 02:31
VMD载入轨迹,save coordinate的地方恰当输入要保存的帧号范围。如果之前不是dcd格式,建议保存成dcd,文件 ...

谢谢卢老师!那我以后都保存成dcd格式~




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3