计算化学公社

标题: 请问在结构优化中，得到的后缀分别是kp和restart有什么区别？ [打印本页]

作者
Author: LIJINWEI 时间: 2025-9-14 16:07
标题: 请问在结构优化中，得到的后缀分别是kp和restart有什么区别？
结构优化过程中，有RESTART.kp和.restart两个文件，请问两者有什么区别？
另外，1.在还在结构优化时，我前面是拿着.restart文件转成.cif文件后，看一下我结构的变化，另外再拿着这个.restart文件转成inp文件，重新跑，同时在新产生的inp文件中，我会改变WFN_RESTART_FILE_NAME中的xxx-RESTART.kp，改成前一个优化的xxx-RESTART.kp，按照这样操作之后，但是发现没有新的restart文件出现，但是kp文件是有的，但是我是更需要restart来查看结构的，请问重新跑时，是不是需要在另外一个文件夹里面。
2.续跑是kp文件，还是restart文件？我试了一下，kp会报错，restart不会，所以续跑是restart吗？但是我现在没有产生新的restart文件，需要中止后，建一个新的文件夹吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-9-14 18:52
restart是文本文件，格式和CP2K输入文件相同，有什么内容打开一看便知。kp是二进制文件，记录的是密度矩阵。二者毫无交集。
几何优化续跑时如果读上一步的波函数当初猜才需要kp文件（对于只考虑gamma点是wfn文件）

作者
Author: LIJINWEI 时间: 2025-9-15 08:55

sobereva 发表于 2025-9-14 18:52
restart是文本文件，格式和CP2K输入文件相同，有什么内容打开一看便知。kp是二进制文件，记录的是密度矩阵 ...

社长，如果续跑，是把WFN_RESTART_FILE_NAME前边的注释消除，同时把后面的改成前面的名字吗？请问还有其他需要改吗？

作者
Author: spinel 时间: 2025-9-15 09:42

LIJINWEI 发表于 2025-9-15 08:55
社长，如果续跑，是把WFN_RESTART_FILE_NAME前边的注释消除，同时把后面的改成前面的名字吗？请问还有其 ...

续跑只需要把restart文件后缀改为inp文件重新提交即可

作者
Author: LIJINWEI 时间: 2025-9-15 09:45

spinel 发表于 2025-9-15 09:42
续跑只需要把restart文件后缀改为inp文件重新提交即可

好的，谢谢您。

作者
Author: LIJINWEI 时间: 2025-9-15 09:51

sobereva 发表于 2025-9-14 18:52
restart是文本文件，格式和CP2K输入文件相同，有什么内容打开一看便知。kp是二进制文件，记录的是密度矩阵 ...

社长，我有一个问题，就是我研究的结构，往里面掺杂原子，经过我多方思考后，发现scf迭代不收敛的原因是结构问题，也就是这个位置太窄了，放不下这个原子，我现在的想法是把scf迭代上限减少，例如50，先进行结构优化，我从结构优化得到的restart文件中，看见这个位置放的原子在慢慢撑开周围原子，慢慢变宽了，所以，我现在就这样让他跑着，把结构撑开，也许这个位置足够大了，是不是就可能scf'迭代收敛了？社长，这样可行吗？同时，我也看见这个结构的对称性发生了变化，这样对于掺杂是不是正常的情况？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-9-16 03:01

LIJINWEI 发表于 2025-9-15 09:51
社长，我有一个问题，就是我研究的结构，往里面掺杂原子，经过我多方思考后，发现scf迭代不收敛的原因是 ...

可以
是

作者
Author: LIJINWEI 时间: 2025-9-16 10:14

sobereva 发表于 2025-9-16 03:01
可以
是

社长，多次优化的结果得知，发现掺杂原子不在撑开周围原子，而是在一定的数值旁边上下些许浮动，甚至可以说不变了，这是不是已经代表优化已经到头了？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-9-16 21:06

LIJINWEI 发表于 2025-9-16 10:14
社长，多次优化的结果得知，发现掺杂原子不在撑开周围原子，而是在一定的数值旁边上下些许浮动，甚至可以 ...

一定程度可以说。但也可能陷在了高能的局部极小点。为了稳妥，可以尝试其它优化算法（如BFGS改成CG），并且调整初始掺杂位置，看结论是否一致

作者
Author: LIJINWEI 时间: 2025-9-17 08:47

sobereva 发表于 2025-9-16 21:06
一定程度可以说。但也可能陷在了高能的局部极小点。为了稳妥，可以尝试其它优化算法（如BFGS改成CG），并 ...

社长，我将掺杂原子周围的原子拉远之后，再次进行优化，发现拉远的原子又回到没拉远的位置上面去了，这是不是代表着现在的位置就是合理的？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-9-17 18:50

LIJINWEI 发表于 2025-9-17 08:47
社长，我将掺杂原子周围的原子拉远之后，再次进行优化，发现拉远的原子又回到没拉远的位置上面去了，这是 ...

是

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