计算化学公社

标题: 请问ChemDraw给出的小分子核磁谱是否可信 [打印本页]

作者
Author: xcgotk 时间: 2025-9-17 12:53
标题: 请问ChemDraw给出的小分子核磁谱是否可信
本帖最后由 xcgotk 于 2025-9-17 13:08 编辑

请问ChemDraw给出的小分子核磁谱是否可信
两个简单小分子拼接得到的产物的核磁是否可信
与使用论坛内的方法计算的核磁有什么区别（使用Multiwfn绘制NMR谱 - 波函数分析与Multiwfn (Wavefunction Analysis & Multiwfn) - 计算化学公社）
希望各位不吝赐教

关于可信，我想知道能否放到论文中和实际做出来的核磁作为参考，比如两个已有的小分子A、B使用ChemDraw生成（如果不行就认真学习上述帖子中的计算方法或者也做核磁），判断AB复合物中少了和多了的峰，同时AB复合物也用ChemDraw生成一个作为参考

作者
Author: zjxitcc 时间: 2025-9-17 13:00
本帖最后由 zjxitcc 于 2025-9-17 13:01 编辑

那是经验规则生成的，一般供实验人员参考，点点鼠标快速出结果，做核磁实验前有个预期，省时间，不可以作为定量计算结果，也不可以拿来当核磁结果报道。

“论坛内的方法计算的核磁”这个太含糊了。如果指的是量子化学/第一性原理计算获得的核磁数据，那比经验规则严谨多了。但在实际应用时还要考虑构象多样性，因为每次只是计算一帧结构的NMR化学位移，对于柔性体系（大量构象之间可以互相转换）需要计算很多帧结构然后做构象平均。当然构象平均也有不同的做法，与此贴关系不大。

“可信”这个描述也是含糊的。

作者
Author: xcgotk 时间: 2025-9-17 13:08

zjxitcc 发表于 2025-9-17 13:00
那是经验规则生成的，一般供实验人员参考，点点鼠标快速出结果，做核磁实验前有个预期，省时间，不可以作为 ...

感谢您的回复，我在原帖进行了补充，请您指教

作者
Author: sobereva 时间: 2025-9-18 02:28
chemdraw只对于成键方式很普通的刚性有机分子，基本上总是能给出合理的结果。其它情况，chemdraw预测的自己不放心，别人也会质疑

作者
Author: xcgotk 时间: 2025-9-18 11:18

sobereva 发表于 2025-9-18 02:28
chemdraw只对于成键方式很普通的刚性有机分子，基本上总是能给出合理的结果。其它情况，chemdraw预测的自己 ...

辛苦卢老师移动分类，感谢您的回复

作者
Author: SharkYYX2025 时间: 2025-9-18 22:27
本帖最后由 SharkYYX2025 于 2025-9-18 22:30 编辑

我也是研究普通有机分子，chemdraw预测的我感觉不太靠谱，就是说，定量不到具体化学位移，我感觉有时候误差和实验能有1-2个ppm。但是定性可以，比如有几组氢，化学位移从大到小顺序是XXXXX，可以用于初步找峰，要不实验的峰找起来费时间。这个预测的数据放文章感觉不太行，至少我没怎么见过。
MestReNova这个软件预测核磁更准，我亲测和实验的化学位移比较接近（但也有<0.5ppm的误差），但是裂分就不能准确描述了。这也是丝滑处理NMR数据的软件。容易上手，可以免费下载。如果你计算不是专业的，我想你用这个预测，比按照贴文计算NMR省事一些。虽然按照贴文计算NMR更准

复合物的NMR和单个小分子可能不一样，我怀疑画的结构式不能描述真实情况下的相互作用位点。还是需要几何优化，找到相互作用位置
活性氢的实验和预测数据通常差异很大，比如氨基羧基。实验上，活性氢可能不出峰。如果你要用这些氢说明问题，感觉会被质疑。烷基，苯环的氢是基本上测出来符合软件预测的结果。定性描述我觉得可以接受，比如AB分子结合之后，某位置H原子预计会向高场位移，说明存在XXX相互作用。但是如果定量讨论移动几个ppm，感觉不太行

作者
Author: xcgotk 时间: 2025-9-19 12:07

SharkYYX2025 发表于 2025-9-18 22:27
我也是研究普通有机分子，chemdraw预测的我感觉不太靠谱，就是说，定量不到具体化学位移，我感觉有时候误差 ...

感谢您的回复，对我帮助很大

作者
Author: glycosylation 时间: 2025-10-17 15:10
做合成出身的人表示，十分不靠谱

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)