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标题: 求助:二面角拟合时MM能量曲线计算出来很奇怪 [打印本页]

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lts!    时间: 2025-9-17 13:04
标题: 求助:二面角拟合时MM能量曲线计算出来很奇怪
本帖最后由 lts! 于 2025-9-17 13:04 编辑

对于以下这样的二面角拟合,我首先用gaussian柔性扫描后得到qm曲线,曲线很平滑很正常,但是在算MM能量时,将该处四个二面角的力常数设置为0之后,得到的mm曲线就很异常没有规律,用QM减去MM后也会变得特别奇怪,我发现我在拟合很多简单体系都会遇到这样的问题,一直不知道是哪里出问题了。
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图1 二面角拟合对象
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图2 qm扫描曲线
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sobereva    时间: 2025-9-18 02:33
一点点简化问题、反复对比找原因
比如把柔性扫描改成刚性扫描、把所有二面角项都去掉再算MM曲线(然后一个个把二面角扭转项加上),等等
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lts!    时间: 2025-9-18 14:42
sobereva 发表于 2025-9-18 02:33
一点点简化问题、反复对比找原因
比如把柔性扫描改成刚性扫描、把所有二面角项都去掉再算MM曲线(然后一个 ...

谢谢老师,我想再问一下这种问题是由于GAFF2预建二面角力常数离实际值偏差比较大导致的吗?
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sobereva    时间: 2025-9-18 23:31
lts! 发表于 2025-9-18 14:42
谢谢老师,我想再问一下这种问题是由于GAFF2预建二面角力常数离实际值偏差比较大导致的吗?

当前用的是周期性的扭转势,谐振势才有力常数的概念
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lts!    时间: 2025-9-19 13:12
sobereva 发表于 2025-9-18 23:31
当前用的是周期性的扭转势,谐振势才有力常数的概念

哦哦不好意思老师,我再学习一下!




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