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标题: 求助用结合能初筛SLS与HisHCl在水中氢键结合的最佳构型 [打印本页]

作者
Author: moiraaa 时间: 2025-9-18 01:36
标题: 求助用结合能初筛SLS与HisHCl在水中氢键结合的最佳构型
各位老师好，我想确定SLS与HisHCl在水中氢键结合的最佳构型。目前已结合静电势图优化出三种结构，计划通过结合能最小值进行粗筛。想请教下，这种粗筛是否需要像社长文章中那样计算结合能？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-9-18 02:00
不需要算结合能。应当比较不同构型的自由能判断，取自由能最低的
自由能计算方式可参考
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552（http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html）

你的问题本质上属于构型搜索，可参考下文中的相关信息
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html
genmer：生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html

作者
Author: moiraaa 时间: 2025-9-19 01:23

sobereva 发表于 2025-9-18 02:00
不需要算结合能。应当比较不同构型的自由能判断，取自由能最低的
自由能计算方式可参考
使用Shermo结合量 ...

好的，谢谢社长

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