计算化学公社

标题: 求助做rerun,如何换算才能分别得到1个A和1.7个B之间的相互作用能? [打印本页]

作者
Author:
风沙    时间: 2025-9-20 21:56
标题: 求助做rerun,如何换算才能分别得到1个A和1.7个B之间的相互作用能?

各位老师好,我按照实验的质量比计算出的模型应该是1个A和1.7个B,但是为了GROMACS模拟方便我在盒子里加入了10个A和17个B,模拟完并rerun之后得到了相互作用能。

有个问题是我该如何换算,才能分别得到1个A和1.7个B之间的静电相互作用能和范德华相互作用能?


或者我这样计算对不对:假设1个A和1.7个B之间的某个相互作用能为X,10个A和17个B之间的某个相互作用能为Y,那么有(1*1.7)/X=(10*17)/Y,也即1个A和1.7个B之间的某个相互作用能为X=(1*1.7)*Y/(10*17)





作者
Author:
student0618    时间: 2025-9-21 01:32
目的是什么?能量好像不能这样搞吧。
作者
Author:
sobereva    时间: 2025-9-21 02:55
可以这样算
作者
Author:
风沙    时间: 2025-9-21 10:26
sobereva 发表于 2025-9-21 02:55
可以这样算

好的,谢谢老师




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3