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标题: 基态6-311G(d,p)优化（30原子以下）,总出现scratch directory ran full的错误求解 [打印本页]
作者
Author: 895098540wkw    时间: 2025-9-22 15:43
标题: 基态6-311G(d,p)优化（30原子以下）,总出现scratch directory ran full的错误求解
小分子体系，30原子以下，选用b3lyp/6-311G(d,p)优化T1结构时，总出现如下问题：


Symmetry not used in FoFCou.
End of G2Drv F.D. properties file   721 does not exist.
End of G2Drv F.D. properties file   722 does not exist.
End of G2Drv F.D. properties file   788 does not exist.
Leave Link 1110 at Wed Sep 17 22:10:37 2025, MaxMem=  8053063680 cpu:            2332.5 elap:             146.6
(Enter /software/sse/easybuild/prefix/software/Gaussian/16.C.01-avx2-nsc1/g16/l1002.exe)
Minotr:  UHF open shell wavefunction.
          IDoAtm=11111111111111111111111111111111
          Direct CPHF calculation.
          Differentiating once with respect to nuclear coordinates.
          Requested convergence is 1.0D-08 RMS, and 1.0D-07 maximum.
          Secondary convergence is 1.0D-12 RMS, and 1.0D-12 maximum.
          NewPWx=T KeepS1=F KeepF1=F KeepIn=T MapXYZ=F SortEE=F KeepMc=T.
         9635 words used for storage of precomputed grid.
Keep R1 and R2 ints in memory in canonical form, NReq=7000593905.
FoFCou: FMM=F IPFlag=           0 FMFlag=           0 FMFlg1=           0
         NFxFlg=           0 DoJE=F BraDBF=F KetDBF=F FulRan=T
         wScrn=  0.000000 ICntrl=       600 IOpCl=  0 I1Cent=           0 NGrid=           0
         NMat0=    1 NMatS0=  83436 NMatT0=    0 NMatD0=    1 NMtDS0=    0 NMtDT0=    0
Symmetry not used in FoFCou.

=== POST-JOB OUTPUT FROM THE NSC g16 WRAPPER ===
Gaussian terminated with a non-zero exit status: 1
Checking whether the scratch directory ran full:
Filesystem                         Size  Used Avail Use% Mounted on
/dev/mapper/vg_scratch-lv_scratch  205G  1.7G  203G   1% /scratch/local

我尝试过直接优化，出现如上问题，也尝试过先用6-31G(d)，再用6-31G(d,p)，最后再用6-311G(d,p)优化，前两步都能成，最后也出现这个问题。
请问老师知道这个问题的原因么？


作者
Author: cym    时间: 2025-9-22 16:34
这个问题最好给出输入，输出文件
作者
Author: 895098540wkw    时间: 2025-9-22 17:17
以上是输入输出文件
作者
Author: mfdsrax2    时间: 2025-9-22 18:41
就是硬盘满了，Linux里面硬盘满不只是存储空间，inode满也会导致写不进去
作者
Author: 895098540wkw    时间: 2025-9-22 19:28
mfdsrax2 发表于 2025-9-22 18:41
就是硬盘满了，Linux里面硬盘满不只是存储空间，inode满也会导致写不进去

我查看了硬盘还有空间，其他任务也一样能计算
作者
Author: snljty2    时间: 2025-9-22 19:53
  1. 作业脚本后面加上
  2. echo $GAUSS_SCRDIR
  3. df -h
  4. 看看。
复制代码
作者
Author: 895098540wkw    时间: 2025-9-22 20:03
snljty2 发表于 2025-9-22 19:53

这么加么？

echo "module load Gaussian/16.C.01-avx2-nsc1-bdist" >> jobfile

echo >> jobfile

echo "cd \$GAUSS_SCRDIR" >> jobfile

echo >> jobfile

echo $GAUSS_SCRDIR
df -h
作者
Author: 895098540wkw    时间: 2025-9-22 20:36
snljty2 发表于 2025-9-22 19:53

Filesystem                           Size  Used Avail Use% Mounted on
devtmpfs                             4.0M     0  4.0M   0% /dev
tmpfs                                189G  321M  188G   1% /dev/shm
tmpfs                                 76G  9.0M   76G   1% /run
efivarfs                             496K  104K  388K  22% /sys/firmware/efi/efivars
/dev/mapper/vg_tetralith1-lv_root    1.0T   60G  964G   6% /
/dev/sda2                            960M  395M  566M  42% /boot
/dev/sda1                            100M  7.1M   93M   8% /boot/efi
/dev/mapper/vg_tetralith1-lv_tmp     1.0T  9.2G 1015G   1% /tmp
/dev/mapper/vg_tetralith1-lv_vartmp  200G  1.5G  199G   1% /var/tmp
home                                  60T   29T   32T  49% /home
proj                                 7.5P  5.1P  2.5P  68% /proj
sw7                                   25T  9.8T   15T  41% /software
tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/10197
tmpfs                                 38G   44K   38G   1% /run/user/1018
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/6738
tmpfs                                 38G   28K   38G   1% /run/user/13362
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/14620
tmpfs                                 38G   48K   38G   1% /run/user/15014
tmpfs                                 38G   72K   38G   1% /run/user/13353
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/15023
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/10772
tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/2516
tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/6028
tmpfs                                 38G   48K   38G   1% /run/user/12433
tmpfs                                 38G   60K   38G   1% /run/user/12636
tmpfs                                 38G   60K   38G   1% /run/user/15088
tmpfs                                 38G   60K   38G   1% /run/user/13620
tmpfs                                 38G   52K   38G   1% /run/user/13188
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/2537
tmpfs                                 38G   60K   38G   1% /run/user/14474
tmpfs                                 38G   72K   38G   1% /run/user/13695
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/13296
tmpfs                                 38G   52K   38G   1% /run/user/13253
tmpfs                                 38G   72K   38G   1% /run/user/15074
tmpfs                                 38G   44K   38G   1% /run/user/14476
tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/3508
10.2.31.1@tcp:/smhid20               3.6P  3.5P  117T  97% /nobackup/smhid20
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/12409
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/10084
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/14501
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/14863
tmpfs                                 38G   52K   38G   1% /run/user/14731
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/12898
tmpfs                                 38G   60K   38G   1% /run/user/14089
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/12111
tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/12224
tmpfs                                 38G   64K   38G   1% /run/user/13264
tmpfs                                 38G   72K   38G   1% /run/user/14988
tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/14830
tmpfs                                 38G   52K   38G   1% /run/user/5283
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/13766
tmpfs                                 38G   60K   38G   1% /run/user/12460
tmpfs                                 38G   12K   38G   1% /run/user/2089
tmpfs                                 38G   64K   38G   1% /run/user/13660
tmpfs                                 38G   52K   38G   1% /run/user/14439
tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/11203
tmpfs                                 38G   36K   38G   1% /run/user/13284
tmpfs                                 38G   64K   38G   1% /run/user/11590
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/13136
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/13334
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/14314
tmpfs                                 38G   60K   38G   1% /run/user/10087
tmpfs                                 38G   52K   38G   1% /run/user/6073
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/6676
tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/10045
tmpfs                                 38G   64K   38G   1% /run/user/14239
tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/12955
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/11184
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/14315
tmpfs                                 38G   28K   38G   1% /run/user/0
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/14867
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/11757
tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/6935
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/11277
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/2071
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/12522
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/13600
tmpfs                                 38G   48K   38G   1% /run/user/14510
tmpfs                                 38G   36K   38G   1% /run/user/11101
tmpfs                                 38G   52K   38G   1% /run/user/15089
10.2.31.9@tcp:/accmls1               6.4P  882T  5.5P  14% /nobackup/accmls1
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/2776
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/10653
tmpfs                                 38G   48K   38G   1% /run/user/15031
tmpfs                                 38G   60K   38G   1% /run/user/14478
tmpfs                                 38G   28K   38G   1% /run/user/10420
tmpfs                                 38G   32K   38G   1% /run/user/6352
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/13883
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/15017
10.2.31.1@tcp:/rossby27              2.2P  2.2P   22T  99% /nobackup/rossby27
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/10244
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/2258
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/5552
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/12656
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/11654
tmpfs                                 38G   52K   38G   1% /run/user/11288
tmpfs                                 38G   52K   38G   1% /run/user/5543
tmpfs                                 38G   52K   38G   1% /run/user/14803
tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/14138
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/15087
tmpfs                                 38G   68K   38G   1% /run/user/15113
tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/13149
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/14640
tmpfs                                 38G   64K   38G   1% /run/user/15099
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/13142
tmpfs                                 38G   52K   38G   1% /run/user/12302
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/13322
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/15077
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/10416
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/13378
tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/11517
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/15054
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/2532
tmpfs                                 38G   64K   38G   1% /run/user/5791
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/10410
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/6642
tmpfs                                 38G   28K   38G   1% /run/user/11017
tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/2636
tmpfs                                 38G   44K   38G   1% /run/user/14664
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/1046
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/6330
tmpfs                                 38G   64K   38G   1% /run/user/11878
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/14652
tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/11218
tmpfs                                 38G   60K   38G   1% /run/user/15036
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/6089
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/15075
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/11187
tmpfs                                 38G   36K   38G   1% /run/user/15068
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/14937
tmpfs                                 38G   28K   38G   1% /run/user/2894
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/15101
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tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/15118
tmpfs                                 38G   28K   38G   1% /run/user/5662
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tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/11759
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tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/13506
tmpfs                                 38G  8.0K   38G   1% /run/user/15051
tmpfs                                 38G   28K   38G   1% /run/user/15043
tmpfs                                 38G   40K   38G   1% /run/user/14295
tmpfs                                 38G   56K   38G   1% /run/user/15069
作者
Author: KazusaT    时间: 2025-9-23 00:17
895098540wkw 发表于 2025-9-22 20:03
这么加么？

echo "module load Gaussian/16.C.01-avx2-nsc1-bdist" >> jobfile

你如果是在集群，就在提交脚本里加
如果是自己跑就直接运行这两行命令



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