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标题: ORCA计算IRC时疑似内存调用出错 [打印本页]

作者
Author: Deepsea_Goose 时间: 2025-9-24 15:35
标题: ORCA计算IRC时疑似内存调用出错
求助！ORCA版本6.1.0，OpenMPI 4.1.8，MacOS 15.6.1。在计算IRC时得到以下的错误信息：

## A system call failed during shared memory initialization that should
not have. It is likely that your MPI job will now either abort or
experience performance degradation.

Local host: YuhangdeMacBook-Pro.local
System call: unlink(2) /var/folders/sj/6pnb_30n0155cbzdtz6d7jg00000gn/T//ompi.YuhangdeMacBook-Pro.501/pid.57532/1/vader_segment.YuhangdeMacBook-Pro.501.21ff0001.10
Error: No such file or directory (errno 2)
[YuhangdeMacBook-Pro.local:57532] 1 more process has sent help message help-opal-shmem-mmap.txt / sys call fail
[YuhangdeMacBook-Pro.local:57532] Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages

这段信息在开始计算Forward时反复出现，导致没有进行任何一个点的IRC的结构计算，直到最后报错退出。当我进行其他的IRC任务时也会出现相同的错误。需要注意的是，我在进行其他类别的任务时（如普通的opt+freq）也会在terminal中发现这段报错信息，但是计算在持续进行没有报错退出，并且能得到正确的结果。目前为止只有IRC计算时会得到报错退出的结果。

我在禁用Vader后确实可以正常运行并得到正确的计算结果了，但是用任务管理器查看后台时发现后台的“系统”占用大幅提升至40%～50%，而“用户”占用降低（总占率，即为二者之和，依旧几乎为100%），而且这种现象可以在禁用Vader时复现在其他计算任务中。在禁用Vader前则是“用户”的占用永远在90%以上，“系统”占用几乎可以忽略不计。这是因为禁用Vader后“系统”因为分配内存的运算而提高了占用吗？这会影响计算效率吗？

我该如何彻底解决这个问题呢？如果不禁用Vader的话该如何操作呢？谢谢大佬们的指教！

作者
Author: Deepsea_Goose 时间: 2025-10-15 21:39
已经解决了，在此讲解一下解决方案来帮助一下后来者。
原因是 macOS 默认临时目录（/var/folders/...）路径过长、残留文件竞争或权限问题，导致文件创建/删除不一致。这时候只要设置 TMPDIR 环境变量至 /tmp，把路径优化了就好了。

首先打开终端，编辑 shell 配置文件，vi ~/.zshrc，然后在里面添加export TMPDIR=/tmp，保存退出后source ~/.zshrc即可。
如果你成功了的话，echo $TMPDIR时会输出/tmp

从此再也没有发生过问题。

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