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标题: 如何找到gmx命令的计算原理 [打印本页]

作者
Author: NEW12138 时间: 2025-9-24 22:29
标题: 如何找到gmx命令的计算原理
今天想找到gmx mindist计算两组最小距离的原理/方式，意思就是：计算最短距离是两个组有原子在一定范围内接触了就算吗，是根据范德华半径判断吗？可是在user guide的command-line reference 部分的说明很简洁，没有涉及原理，在网上搜索的时候发现有说manual里面有，附了一张截图如下
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可我在user guide的reference manual部分也没有找到，所以想请问一下各位老师，是应该去哪里的网址查找这部分内容呢

作者
Author: sobereva 时间: 2025-9-24 23:54
跟范德华半径毫无关系

北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/KGMX）里讲了例子

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作者
Author: NEW12138 时间: 2025-9-25 09:00

sobereva 发表于 2025-9-24 23:54
跟范德华半径毫无关系

北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/KGMX）里讲了例子

收到，谢谢老师，所以其实最完整的说明就在comman-line reference部分了是吗

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