计算化学公社
标题:
Nonadiabatic molecular dynamics模拟过程中氢转移的疑问?
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作者Author:
xhzai
时间:
2025-9-25 16:27
标题:
Nonadiabatic molecular dynamics模拟过程中氢转移的疑问?
本帖最后由 xhzai 于 2025-9-26 10:18 编辑
嗯本人是一名物理专业的学生,对氢转移了解的不足。有些疑问想请教各位老师们。
我在做nh3二聚体电离过后的非绝热动力学模拟过程中发现他的质子转移过程是转移的一开始位于氢键上的氢。我查阅文章发现这是一种正常的氢转移路径。如图所示:转移的氢键上的氢。
但是我在做另一个小分子二聚体体系的时候发现:他电离过后转移的是供体上非氢键的氢。不管是电离homo还是homo-1都是如此。他的动力学演化过程是这样。
1:一开始供体上有两个氢原子设为h1,h2.一开始h1和受体相连形成氢键。
2:在演化了几十飞秒的过程中,供体上的氢在振动,h1开始远离受体,h2开始靠近受体
3:在后续演化的过程中h2跑到了受体上完成了氢转移,而h1继续在供体上
4:在又演化了一段时间过后,供体受体两部分开始远离。
我的疑问就是:这种情况是存在的吗?有没有类似的文章讨论过的啊?还是说大家默认的是氢转移过去就好了,并不用关注一开始静态结构上到底是哪一个氢和受体相连形成氢键?因为你模拟电离过后的动力学过程,分子的结构本来就要重排。并不一定要静态结构氢键上的氢转移。
嗯:我这些其实应该说的是质子转移,从阳离子转移一个h到中性受体上。
作者Author:
Daniel_Arndt
时间:
2025-9-26 14:53
我不大了解这个方面,但你的描述让我想起来之前一次讲座上听过的一个多年前的实验,氯乙烯得一个电子后,如果电子打到π*轨道,最终是能观察到氯离子的;如果电子打到σ*轨道,虽然碳氯键会拉长,但在拉长的过程中电子很快就跑出来了,最后观察不到氯离子。
也许你可以查查一些反应中的roaming mechanism。
作者Author:
xhzai
时间:
2025-9-26 17:32
本帖最后由 xhzai 于 2025-9-26 18:59 编辑
谢谢你的回答我会去看下roaming过程的,但是我个人感觉不是roaming过程,我问了下我的师兄:他说以他的了解这应该不是roaming过程。我现在问题是这个:二聚体氢键体系质子转移过程转移氢大家默认的是否是中性结构上氢键的氢,由于我不是化学系的,我了解的不足,并不明确他们怎么规定的,我看了些文章,大家好像都是默认的转移的氢键上的氢。
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