计算化学公社

标题: 求助：关于计算SASA比较溶解度的疑问 [打印本页]

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Author: Lisy 时间: 2025-9-25 18:25
标题: 求助：关于计算SASA比较溶解度的疑问
各位老师，我想通过gromacs计算比较不同聚合物链在有机溶剂中的溶解度，请问可以通过计算SASA来进行比较吗？溶解度低则算出来聚合物链的SASA会比较小，还是说SASA中的溶剂只能是水呢？

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Author: sobereva 时间: 2025-9-26 03:47
光靠SASA完全不能分析溶解度大小
诸如两个聚合物SASA都正好一样，一个带的极性基团多，一个是纯烃链，显然前者在水中的更容易溶

作者
Author: Lisy 时间: 2025-9-26 09:03

sobereva 发表于 2025-9-26 03:47
光靠SASA完全不能分析溶解度大小
诸如两个聚合物SASA都正好一样，一个带的极性基团多，一个是纯烃链，显然 ...

那应该怎么衡量比较两种聚合物在有机溶剂中的溶解度呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-9-26 09:31

Lisy 发表于 2025-9-26 09:03
那应该怎么衡量比较两种聚合物在有机溶剂中的溶解度呢？

寻找经验预测公式，算出描述符代入。最严格的是用GROMACS跑分子动力学模拟

作者
Author: Lisy 时间: 2025-9-26 10:14

sobereva 发表于 2025-9-26 09:31
寻找经验预测公式，算出描述符代入。最严格的是用GROMACS跑分子动力学模拟

卢老师，我就是想用gromacs来跑模拟的，但不知道能怎么去很好地比较，目前我只想到也许能比较不同聚合物和有机溶剂的相互作用能，rdf这些，不知道还有没有其他量可以更直接地比较

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Author: sobereva 时间: 2025-9-27 01:20

Lisy 发表于 2025-9-26 10:14
卢老师，我就是想用gromacs来跑模拟的，但不知道能怎么去很好地比较，目前我只想到也许能比较不同聚合物 ...

从文献里找找有没有相关的参数定义，没有的话就凭基本逻辑定义能说事的指标并自己写脚本统计，虽然没法得到严格的溶解度，但至少能衡量溶解性的相对大小，比如聚合物分子几埃内水的数目或者其它聚合物的原子数、平均每个聚合物分子与水的接触面积占聚合物面积百分比，等等。显然如果溶得充分，聚合物分子会尽可能充分与水接触。

作者
Author: Lisy 时间: 2025-9-27 11:15

sobereva 发表于 2025-9-27 01:20
从文献里找找有没有相关的参数定义，没有的话就凭基本逻辑定义能说事的指标并自己写脚本统计，虽然没法得 ...

好的，太感谢卢老师了！

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