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标题: 求助CeO2优化过程中Total charge density的数值问题 [打印本页]

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Author: shibanfish 时间: 2025-9-28 14:03
标题: 求助CeO2优化过程中Total charge density的数值问题
老师我想问一下，我刚才在跑含一个氧空位的CeO2(111)表面时输出了如下内容

Total charge density on r-space grids: 0.0000000879
Total charge density g-space grids: 0.0000000879

我看了这个帖子https://www.cp2k.org/faq:cutoff上说上面两个输出数值应该小于10的-8次方，但我这两个数值都比10的-8次方大，我想问一下老师您这问题应该怎么解决@Uus/pMeC6H4-/キ

作者
Author: sobereva 时间: 2025-9-28 14:13
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “CeO2优化过程中几何优化不收敛的解决方法” 改了，以后务必注意

当前问题和几何优化不收敛根本没有丝毫关系，标题不要乱写

作者
Author: sobereva 时间: 2025-9-28 14:14
根本不需要解决，没什么可解决的，至少不给出输入文件的情况下没法进行更多评论

作者
Author: shibanfish 时间: 2025-9-28 14:59
抱歉社长，我以后会注意的。我现在把car文件和cp2k输入文件发出来，麻烦你看一下问题出在哪

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-9-28 16:05
用multiwfn加载CP2K输入文件可见盒子尺寸完全不对，三个方向都有大量真空区使得体系成了孤立团簇。不知道这建模怎么弄的，反正生成CP2K输入时给multiwfn读取结构的文件必须记录合理的晶格矢量，比如用cif之类。另外原子冻结的意义也不太清楚，在有氧空位的情况下净电荷、自旋多重度及是否需要启用smearing还得小心考虑。

作者
Author: shibanfish 时间: 2025-9-28 18:23

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-9-28 16:05
用multiwfn加载CP2K输入文件可见盒子尺寸完全不对，三个方向都有大量真空区使得体系成了孤立团簇。不知道这 ...

好的老师，我知道问题出在哪了，我这就去修改

作者
Author: shibanfish 时间: 2025-9-29 18:20
本帖最后由 shibanfish 于 2025-10-14 11:44 编辑

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-9-28 16:05
用multiwfn加载CP2K输入文件可见盒子尺寸完全不对，三个方向都有大量真空区使得体系成了孤立团簇。不知道这 ...

谢谢老师，重新建模以后体系很快就收敛了，但我想麻烦您看一下，这个结构算不算周期性体系，另外再帮忙看一下，这几个体系的inp输入文件有没有问题，计算了很长时间结构优化都没有收敛，带两个氧空位的CeO2体系跑了484步，每步平均时间984s，Pt13/CeO2体系跑了246步，每步平均时间6262s,带一个氧空位的Pt13/CeO2体系跑了238步，每步平均时间6348s

作者
Author: shibanfish 时间: 2025-10-15 16:33
本帖最后由 shibanfish 于 2025-10-15 17:03 编辑

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-9-28 16:05
用multiwfn加载CP2K输入文件可见盒子尺寸完全不对，三个方向都有大量真空区使得体系成了孤立团簇。不知道这 ...

好的老师，我想问一下，我这种情况可以将&OT里的ALGORITHM从默认的STRICT改为IRAC吗，这样会收敛的快一些吗，另外，怎么判断CPU和内存是否与体系原子数相称呢？

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-10-15 17:29
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2025-10-15 17:37 编辑

shibanfish 发表于 2025-10-15 16:33
好的老师，我想问一下，我这种情况可以将&OT里的ALGORITHM从默认的STRICT改为IRAC吗，这样会收敛的快一些 ...

缺陷体系带隙可能比较小，我认为不适合用OT算法，哪怕看起来OT比对角化收敛性好也不应该用。

我说的“CPU和内存能与体系原子数相称”是指在排除其他收敛困难导致计算缓慢的因素之后为了减少耗时而给原子数多的体系用更多CPU和内存，影响的更多是(1)每步SCF迭代的耗时，至于(2)单步几何优化里SCF收敛所需迭代圈数或者(3)几何优化收敛所需迭代圈数那就不好说。还是对照http://sobereva.com/665看看任务总时长太长是上述(1)(2)(3)哪点因素为主吧。有条件用不同计算节点算不同任务，同一计算节点内没有其他任务要跑的话调节mpirun的选项让当前计算任务尽量占满核心数和内存。

作者
Author: shibanfish 时间: 2025-10-21 09:27

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-10-15 17:29
缺陷体系带隙可能比较小，我认为不适合用OT算法，哪怕看起来OT比对角化收敛性好也不应该用。

我说的“ ...

好的老师，我想问一下，如果遇到结构优化比较难收敛的情况，是否可以先用CG优化器优化，然后切换到BFGS或LBFGS优化器？@sobereva

作者
Author: sobereva 时间: 2025-10-21 21:44

shibanfish 发表于 2025-10-21 09:27
好的老师，我想问一下，如果遇到结构优化比较难收敛的情况，是否可以先用CG优化器优化，然后切换到BFGS或 ...

原理上可以。但没必要CG收敛后再切换

作者
Author: shibanfish 时间: 2025-10-22 12:02
好的老师，我想问一下，我的这些初始结构是不是有问题，我刚才在优化的时候最大力一直不收敛，是不是CeO2的氧空位构建有问题，以及Pt团簇不应该放在氧空位上？@Uus/pMeC6H4-/キ

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