计算化学公社

标题: 求助·OH夺取环己烷H原子的过渡态有多个虚频,怎样消除 [打印本页]

作者
Author:
AuAuAu    时间: 2025-9-29 10:29
标题: 求助·OH夺取环己烷H原子的过渡态有多个虚频,怎样消除
  老师们好,我在寻找·OH夺取环己烷H原子的过渡态,发现了过渡态存在多个虚频,已经尝试过改变manual displacement=0.3 ,加int=superfine 或者opt=tight命令,都无法解决,特此求助。

TS1-3 #p opt=(modredundant,noeigen) freq b3lyp/def2svp empiricaldispersion=gd3bj

TS1-4 #p opt=(modredundant,noeigen) freq b3lyp/def2svp int=superfine empiricaldispersion=gd3bj  加int=superfine

TS1-5 #p opt=(modredundant,noeigen) freq b3lyp/def2svp empiricaldispersion=gd3bj  改变manual displacement=0.3

TS1-6#p opt=(modredundant,noeigen,tight) freq guess=read geom=check b3lyp/def2svp scf=qc empiricaldispersion=gd3bj opt=tight命令

TS1-7 #p opt=(calcfc,noeigen,TS,tight) freq b3lyp/def2tzvp int=superfine empiricaldispersion=gd3bj  改变manual displacement=0.3 加int=superfine  opt=tight命令 但是502错误





作者
Author:
sobereva    时间: 2025-9-29 12:07
别自己手写[Gaussian/gview]这种标签,给你去了,以后注意
作者
Author:
AuAuAu    时间: 2025-9-29 12:46
sobereva 发表于 2025-9-29 12:07
别自己手写[Gaussian/gview]这种标签,给你去了,以后注意

好的社长,没有注意到
作者
Author:
北大-陶豫    时间: 2025-9-29 18:43

在寻找·OH夺取环己烷H原子的过渡态
如果你确定当前 HO...H 键长比较接近过渡态中的真实键长,可以固定此键长,进行结构优化(优化到极小点,不是过渡态);如果你不确定,可以做个 relaxed scan 试试。
你这个体系不是 “·OH夺取环己烷H原子的过渡态”吧,下面怎么还有一大堆原子




作者
Author:
AuAuAu    时间: 2025-9-30 20:51
北大-陶豫 发表于 2025-9-29 18:43
如果你确定当前 HO...H 键长比较接近过渡态中的真实键长,可以固定此键长,进行结构优化(优化到极小点, ...

谢谢老师,那我还有一个疑问"可以固定此键长,进行结构优化,优化到极小点"这个意思是指用固定键长优化后极小点的结构作为找过渡态初猜结构吗

下面的原子是我的催化剂。
作者
Author:
wzkchem5    时间: 2025-9-30 21:07
可以考虑用ORCA优化过渡态,消掉多余的虚频后再改回高斯优化。ORCA有自动消虚频的功能,除了优化极小值点时消除所有的虚频以外,也可以用来消除过渡态的多余的虚频:https://www.faccts.de/docs/orca/ ... rative-optimization




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3