计算化学公社

标题: 怎么比较方便的得到波函数分析文件? [打印本页]

作者
Author:
路人癸    时间: 2025-10-5 19:04
标题: 怎么比较方便的得到波函数分析文件?
求助各位大佬,老师,就我已知的方法是用G16做几何结构优化的时候,得到的chk文件转变为fch,但是用高斯做几何结构优化,分子数多的话算不了,那我就得不到完整体系的fch文件,求

作者
Author:
wal    时间: 2025-10-5 19:08
换xtb
作者
Author:
zjxitcc    时间: 2025-10-5 19:39
本帖最后由 zjxitcc 于 2025-10-5 19:43 编辑

你可能想说的是“原子数多的话算不了”,不是“分子数多的话算不了”。150原子以下的常规体系用Gaussian的DFT做结构优化和频率分析不是难题;一两百个原子的常规体系用ORCA的DFT配合RI加速,也不是难题。500原子以上的有机、生物大分子,适合采用线性标度分块方法(例如GEBF, MFCC, MBE)结合DFT进行相应的计算,算一两千原子没问题。如果是上千原子的常规体系,想算得快+精度要求不高,可以使用半经验量子化学方法,例如xTB程序里的GFN2-xTB方法。注意,xTB是程序,它里面实现了很多方法例如GFN-FF, GFN0-xTB, GFN1-xTB, GFN2-xTB等等,程序与方法不能混淆。

如果研究的体系是周期性的(石墨烯、MOF、固体、金属氧化物等等),应当采用CP2K/QE/VASP等周期性的第一性原理程序进行计算,不适合挖个孤立团簇用Gaussian/ORCA硬算。

作者
Author:
Uus/pMeC6H4-/キ    时间: 2025-10-5 19:42
服务器/超算机时及资源多少,分子总数多少、特征如何(基态还是激发态、有无双自由基或多自由基等复杂电子结构、有无过渡金属原子、每个分子总共多少原子等),已经有立体笛卡尔坐标还是要自行从头生成三维结构(包括从字符串或非立体结构文件生成,以及从晶体结构提取等),希望在什么级别优化,要拿波函数文件做什么分析?按http://sobereva.com/620把所有这些细节都讲清楚才能提供建议,另外写shell脚本等做批处理是免不了的。
作者
Author:
sobereva    时间: 2025-10-6 11:45
“方便”用词不当,看你的意思,你只是想低耗时得到大体系的波函数文件用于Multiwfn分析

没有具体信息没法准确回答。如果坚持DFT计算,不重要的部分可以截去或用小基组。如果之前一直用的Gaussian,单点计算部分可以改用ORCA靠RIJ(纯泛函)、RIJCOSX(杂化泛函)显著节约耗时。如果显著放宽对波函数质量的要求,用xtb做PTB计算(比GFN2-xTB的波函数质量更好),产生的molden文件用Multiwfn也能分析。

鉴于很多人对PTB不了解,顺带给出北京科音高级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KAQC)里详细讲GFN系列方法的理论知识和xtb程序部分的幻灯片:
(, 下载次数 Times of downloads: 3)





欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3