计算化学公社

标题: 将ORCA中scan/irc结果转换为gaussview可识别结果的脚本 [打印本页]

作者
Author: Kevin_Chen 时间: 2025-10-7 22:51
标题: 将ORCA中scan/irc结果转换为gaussview可识别结果的脚本
本帖最后由 Kevin_Chen 于 2025-10-10 15:18 编辑

(, 下载次数 Times of downloads: 10)
之前在使用ORCA的xtb进行柔性扫描时发现OfakeG程序无法将scan结果转化为Gaussview可识别的结果，故写了一个比较粗糙但是可以使用的脚本
这个是ORCA输入文件 (, 下载次数 Times of downloads: 8)
输出文件太大了传不上来，放一下转换的结果 (, 下载次数 Times of downloads: 2) 趋势可以看出来，但是无法像Gaussian原生的那样显示以扫描的参数作为横轴，这样可以方便一些过渡态初猜，但总体比较粗糙，欢迎各位大神改进。
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2025/10/10第二次增加：又写了一个将irc的输出trj.xyz转为Gaussian可以识别结果的脚本，在此分享 (, 下载次数 Times of downloads: 9)

作者
Author: leduo 时间: 2025-12-11 15:55
请问这个trj_fake.py脚本怎么使用？我运行它出现这个，但是拖入文件回车并没有反应。PS C:\Users\Administrator\AppData\Local\Programs\Microsoft VS Code> & C:\Users\Administrator\AppData\Local\Microsoft\WindowsApps\python3.11.exe d:/Downloads/trj_fake.py
Which file do you want to convert?

作者
Author: Kevin_Chen 时间: 2025-12-15 15:09
本帖最后由 Kevin_Chen 于 2025-12-15 15:11 编辑

leduo 发表于 2025-12-11 15:55
请问这个trj_fake.py脚本怎么使用？我运行它出现这个，但是拖入文件回车并没有反应。PS C:%users\Administr ...

把脚本放到需要转换的文件的目录下，然后用命令行python trj_fake.py，然后显示Which file do you want to convert?的时候输入你的trj.xyz的名字，就可以转换了，我写的时候是用wsl做的测试，不知道windows会不会有兼容性问题，如果不行的话可以用wsl运行试一下。

作者
Author: leduo 时间: 2025-12-18 21:05

Kevin_Chen 发表于 2025-12-15 15:09
把脚本放到需要转换的文件的目录下，然后用命令行python trj_fake.py，然后显示Which file do you want t ...

谢谢，我试了，可以运行了。但是我还有几个问题：1、输出的fake文件用GaussView打开的时候会弹出报错的对话框是正常的吗？2、我计算的是irc，在result部分看不了irc，但是可是看optimization，这个optimization其实就是原本的irc曲线对吗？谢谢

作者
Author: Teresa 时间: 2026-1-4 15:43

leduo 发表于 2025-12-18 21:05
谢谢，我试了，可以运行了。但是我还有几个问题：1、输出的fake文件用GaussView打开的时候会弹出报错的对 ...

应该是，最终轨迹就转化_IRC_Full_trj.xyz文件

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