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标题: 自由基材料的振动光谱计算出现报错 [打印本页]

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Author: nuobai 时间: 2025-10-9 09:40
标题: 自由基材料的振动光谱计算出现报错
在linux系统中计算FC 光谱，第一步正常计算完成，但在第二步计算基态结构优化并联系激发态分子时系统出现如下报错：
Scratch directory /home/tmp/wsx/1967.master created.
Using /home/tmp/wsx/1967.master for temporary Gaussian 16.C02 files.
Starting Gaussian run at 2025年 10月 09日星期四 08:17:44 CST
Error: segmentation violation
rax 0x0000000000000000, rbx 0x00000000015044b0, rcx 0xffffffffffffffff
rdx 0x000000000003bc95, rsp 0x00007ffda574f898, rbp 0x00000000014ff860
rsi 0x000000000000000b, rdi 0x000000000003bc95, r8  0x00000000014e9a10
r9  0x0000000065884570, r10 0x00007ffda574eca0, r11 0x0000000000000202
r12 0x00000000014ff8e0, r13 0x00007ffda574fdd0, r14 0x0000000000000025
r15 0x00000000015032e0
  /lib64/libpthread.so.0(+0xf630) [0x7ffb23202630]
  /lib64/libc.so.6(kill+0x7) [0x7ffb22b59657]
Error: segmentation violation
rax 0x0000000000000000, rbx 0x00000000015044b0, rcx 0xffffffffffffffff
rdx 0x000000000003f671, rsp 0x00007ffc5c57f418, rbp 0x00000000014ff860
rsi 0x000000000000000b, rdi 0x000000000003f671, r8  0x00000000014e9a10
r9  0x0000000064eca570, r10 0x00007ffc5c57e820, r11 0x0000000000000206
r12 0x00000000014ff8e0, r13 0x00007ffc5c57f950, r14 0x0000000000000025
r15 0x00000000015032e0
  /lib64/libpthread.so.0(+0xf630) [0x7f3e005b9630]
  /lib64/libc.so.6(kill+0x7) [0x7f3dfff10657]

real       11m24.398s
user       821m6.968s
sys       22m42.713s
Finished Gaussian run at 2025年 10月 09日星期四 08:40:35 CST
Work Dir is : /home/wsx/data/250927-state=2/jixiaodian/TTM
SCRDIR is: /home/tmp/wsx/1967.master
out文件报错如下：

作者
Author: sobereva 时间: 2025-10-9 14:17
你都没写geom=connectivity，又在坐标后面出现了连接关系而且又要从输入文件末尾读取信息，当然导致读取错误。从提示明显看到把连接关系当成文件名读取了

作者
Author: nuobai 时间: 2025-10-9 16:28

sobereva 发表于 2025-10-9 14:17
你都没写geom=connectivity，又在坐标后面出现了连接关系而且又要从输入文件末尾读取信息，当然导致读取错 ...

好的，谢谢sober老师

作者
Author: wzkchem5 时间: 2025-10-10 10:28
如果待算分子是自由基，注意自旋污染问题。如果激发态自旋污染严重，高斯计算结果是不能发表的，必须用BDF等软件做自旋匹配TDDFT计算。参见https://mp.weixin.qq.com/s/1qA_QZRzYZxN6MVJw44Wfg

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