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标题: 关于合并多个蛋白质构象pdb文件的问题 [打印本页]

作者
Author: wang011127 时间: 2025-10-15 01:46
标题: 关于合并多个蛋白质构象pdb文件的问题
我将100ns的分子动力学模拟结果绘制了FEL图，并且将最低能量的一批构象根据对应的时间使用gromacs提取了出来，一共有100多个pdb文件，我如何才能将这些构象的pdb文件组合起来用于聚类等一系列分析呢？还请大家指教，感谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2025-10-15 21:20
直接用cat *.pdb > new.pdb就合并成了多帧的pdb文件。注意每帧末尾应当有一行END分隔

作者
Author: wang011127 时间: 2025-10-16 00:49

sobereva 发表于 2025-10-15 21:20
直接用cat *.pdb > new.pdb就合并成了多帧的pdb文件。注意每帧末尾应当有一行END分隔

谢谢社长，仔细查询了一些帖子发现您有说过，我将他们整合在了一起然后用vmd导出trr轨迹后再用gromacs进行了进一步的分析

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