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标题: Confab与Molclus联用能否做约束采样？ [打印本页]

作者
Author: sun877469558 时间: 2025-10-15 12:06
标题: Confab与Molclus联用能否做约束采样？
请问各位老师，sob老师《将Confab或Frog2与Molclus联用对有机体系做构象搜索》（http://bbs.keinsci.com/thread-20063-1-1.html）一文中提到Confab可以通过openbabel实现，那么如果我想在构象生成生成阶段就进行限制性生成，固定一部分原子，只对有机小分子的R基进行构象生成，随后再进行优化等等，请问如何实现呢？就像下图一样

作者
Author: sobereva 时间: 2025-10-15 20:58
对于当前例子中的分子，直接用gentor恰当指定要旋转的键就完了，只涉及要构象搜索的部分。不需要用confab
gentor：扫描方式做分子构象搜索的便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html

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