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标题: 求助，PEG和残基ALA的连接拓扑怎么拼接回原来的蛋白质拓扑中 [打印本页]

作者
Author: yangguofeng 时间: 2025-10-15 17:08
标题: 求助，PEG和残基ALA的连接拓扑怎么拼接回原来的蛋白质拓扑中
求助一下大家，因为peg和蛋白质的结构太大，我将他们需要连接的片段截取出来使用高斯view进行手动的连接，建键。然后进行高斯优化，现在高斯优化已经完成了。我应该怎么将他们拼回去啊。

作者
Author: student0618 时间: 2025-10-15 18:44
如果top itp中残基名、原子名、原子序号和本来的gro一致就可以直接用。

作者
Author: yangguofeng 时间: 2025-10-15 19:59

student0618 发表于 2025-10-15 18:44
如果top itp中残基名、原子名、原子序号和本来的gro一致就可以直接用。

不一样，我在进行拼接的时候对拼接的原子进行了删氢操作，而且高斯优化后，它将其转为了一个整体。

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