计算化学公社

标题: 求助模拟外加电场结冰时使用npt系综，体系会被无限制的压缩 [打印本页]

作者
Author: Layman 时间: 2025-10-15 17:36
标题: 求助模拟外加电场结冰时使用npt系综，体系会被无限制的压缩
各位老师，请问一下，我在模拟外加电场结冰时，使用npt系综，体系会被无限制的压缩，这时候应该使用什么系综合适？同时如果不想让放置的冰被击碎，添加posre.itp限制是否可行？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-10-15 20:16
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “电场下结冰” 改了，以后务必注意！

作者
Author: sobereva 时间: 2025-10-15 20:17
先说清楚当前用的压浴设置、电场是多大

可以

作者
Author: Layman 时间: 2025-10-16 09:07

sobereva 发表于 2025-10-15 20:17
先说清楚当前用的压浴设置、电场是多大

可以

老师，我的压浴设置如下
Pcoupl = Berendsen
pcoupltype = semiisotropic
tau_p = 0.5
ref_p = 1.01325 1.01325
compressibility = 4.5e-5 4.5e-5
；
电场设置为5v/nm

作者
Author: sobereva 时间: 2025-10-16 13:44

Layman 发表于 2025-10-16 09:07
老师，我的压浴设置如下
Pcoupl = Berendsen
pcoupltype = semiisotropic

尝试更小电场（除非文献里确实用过这么大的）、尝试垂直于界面方向可压缩系数设0

作者
Author: Layman 时间: 2025-10-16 14:21

sobereva 发表于 2025-10-16 13:44
尝试更小电场（除非文献里确实用过这么大的）、尝试垂直于界面方向可压缩系数设0

好的，谢谢老师

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)