计算化学公社

标题: 请教gmx_MMPBSA的安装 [打印本页]

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作者
Author: wang011127    时间: 2025-10-17 15:48
标题: 请教gmx_MMPBSA的安装
官网的env.yml文件如下：

1. name: gmxMMPBSA
   
2. channels:
   
3.   - defaults
   
4.   - conda-forge
   
5. dependencies:
   
6.   - python=3.11.8
   
7.   - pip
   
8.   - numpy=1.26.4
   
9.   - ambertools=23.6
   
10.   - mpi4py=4.0.1
    
11.   - matplotlib=3.7.3
    
12.   - scipy=1.14.1
    
13.   - parmed=4.2.2
    
14. 
    
15. 
    
16.   - pandas=1.5.3
    
17.   - seaborn=0.11.2
    
18.   - tqdm
    
19. 
    
20.   - git
    
21.   - gromacs<=2024.3
    
22.   - pip:
    
23.       - pyqt6==6.7.1

复制代码

但似乎我安装的版本和这些都不大一样，比如我的gromacs的版本是2024.5，python的版本是3.13.7，ambertool的版本是2024版，conda的版本是25.9.1，请问我该如何修改这些参数呢？麻烦大家指教，非常感谢！

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作者
Author: KazusaT    时间: 2025-10-17 17:15
我不知道他跟gromacs版本的搭配如何，不过你直接conda create一个新虚拟环境装他指定的python库不就好了？

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作者
Author: wbqdssl    时间: 2025-10-17 17:23
按这个贴子的命令安装试试：http://bbs.keinsci.com/thread-54666-1-1.html

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