计算化学公社

标题: 运行Gromacs报错“top文件的atomtype顺序无效” [打印本页]

作者
Author: 璃陌51129 时间: 2025-10-18 21:57
标题: 运行Gromacs报错“top文件的atomtype顺序无效”
本帖最后由璃陌51129 于 2025-10-18 21:57 编辑

我是理论计算小白，目前在自学GROMACS，模拟的体系是电解液，根据相关论坛帖子做了一些工作，但是GROMACS运行一直报错，根据报错指令做了相关修改也还是不行，反而错误变得更多了，想请各位老师帮我看一下分别是哪里出了问题。目前最新的报错是：
Fatal error:
Syntax error - File run.top, line 3
Last line read:
'[ atomtypes ]'
Invalid order for directive atomtypes
For more information and tips for troubleshooting

作者
Author: student0618 时间: 2025-10-18 22:03
本帖最后由 student0618 于 2025-10-18 22:04 编辑

老生常谈的grompp提示Invalid order for directive atomtypes报错答疑专帖
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 45783&fromuid=64740
(出处: 计算化学公社)

这个Error搜一搜就有哦，也在推荐主题了。

作者
Author: Eianghuan 时间: 2025-10-19 16:26
这几个itp文件中的atomstype一栏要剪切走，放到第一个itp文件中，重复的原子定义要删掉，[atomstype]这个标题只留一个

作者
Author: 璃陌51129 时间: 2025-10-20 09:08

student0618 发表于 2025-10-18 22:03
老生常谈的grompp提示Invalid order for directive atomtypes报错答疑专帖
http://bbs.keinsci.com/forum. ...

好的谢谢老师

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