计算化学公社

标题: 在VMD中绘制IGMH等值面图报错 [打印本页]

作者
Author: qq1966789 时间: 2025-10-22 12:39
标题: 在VMD中绘制IGMH等值面图报错
我用使用Multiwfn结合CP2K通过NCI和IGM方法图形化考察固体和表面的弱相互作用 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元里面的方法，出现了问题
步骤：
20  //图形化分析弱相互作用
10  //IGM
2  //定义两个片段
1-72  //第一个片段的原子序号，即两层COF其中一层中的原子
73-144  //第二个片段的原子序号，即另一层COF中的原子
9  //借助晶胞信息设置格点
[按回车]  //用0,0,0作为盒子原点
[按回车]  //用晶胞边长作为盒子边长
0.4  //格点间距。然后将生成的dg_inter.cub、dg_intra.cub、dg.cub和sl2r.cub，将它们都挪到VMD目录下。并且把Multiwfn目录下的examples文件夹中的IGM绘图脚本IGM_inter.vmd和IGM_intra.vmd都复制到VMD目录下。
然后打开vmd输入source IGM_inter.vmd 。出现了问题。请各位大佬指导一下我哪里出现了问题。
通过网盘分享的文件：输入文件和生成文件.zip
链接: https://pan.baidu.com/s/1UoLLf5W9Tq2ucB8j3Hcx8Q 提取码: rc37

作者
Author: student0618 时间: 2025-10-22 13:00
vmd 命令行那边pwd看所在目录
cd到有cub文件的目录或将cub文件放在该目录

作者
Author: qq1966789 时间: 2025-10-22 13:52

student0618 发表于 2025-10-22 13:00
vmd 命令行那边pwd看所在目录
cd到有cub文件的目录或将cub文件放在该目录

好的，谢谢大佬的指导，我已经放在该目录了，还是识别不到文件

作者
Author: sobereva 时间: 2025-10-23 08:21

qq1966789 发表于 2025-10-22 13:52
好的，谢谢大佬的指导，我已经放在该目录了，还是识别不到文件

纯粹是要被读取的cub文件没放在当前目录下，脚本找不到文件，没有任何其它原因
当前目录在VMD的命令行窗口用pwd命令查看

作者
Author: qq1966789 时间: 2025-10-24 09:50

sobereva 发表于 2025-10-23 08:21
纯粹是要被读取的cub文件没放在当前目录下，脚本找不到文件，没有任何其它原因
当前目录在VMD的命令行窗 ...

好的，谢谢社长指导

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