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标题: 请教,钙离子交联多糖的体系中钙离子的力场选择什么 [打印本页]

作者
Author:
Eianghuan    时间: 2025-10-22 17:51
标题: 请教,钙离子交联多糖的体系中钙离子的力场选择什么
请教各位老师,我在实验中发现钙离子能够交联我的多糖,现在想用MD模拟微观的过程,多糖用GLYCAM产生了pdb文件并转化为了gromacs所需的拓扑文件,请问钙离子应该用什么力场比较合适呀?



作者
Author:
Eianghuan    时间: 2025-10-24 16:19
我尝试了Amber99sb.ff,能够和多糖的磺酸基良好结合,但不知道合不合理,有同样问题的同学可以尝试一下




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