计算化学公社

标题: 不同溶剂下计算UV-VIS光谱 [打印本页]

作者
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beidiwu    时间: 2017-4-20 23:15
标题: 不同溶剂下计算UV-VIS光谱
本帖最后由 beidiwu 于 2017-4-20 23:30 编辑

请各位老师解惑!本人新手一枚,计算某结构UV-VIS步骤如下:
1. 优化结构
关键词# opt b3lyp/6-31+g(d,p)

2. 计算激发态
水溶剂# td=(nstates=50) CAM-B3LYP/6-311G(d) scrf=(pcm,solvent=water)
得到uv-vis与实验两个个峰的峰型一致,但位置有10nm左右的偏差,发现实验用的溶剂应为50%water,50%acetonitrile
于是计算乙腈条件下光谱,看峰如何移动,如下:
乙腈溶剂# td=(nstates=50) cam-b3lyp/6-311g(d) scrf=(solvent=acetonitrile,pcm)
但两种溶剂得到的UV-VIS位置基本一致,偏差不超过1nm,请问哪里出了问题?我不太确定关键词是否正确,请指正!不胜感激!


作者
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sobereva    时间: 2017-4-21 04:48
相差只有10nm已经算很不错了
关键词没有问题。不过为了和实验对比,还是最好用混合溶剂,怎么自定义这里写了
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327

UV-Vis受溶剂的介电常数的数值的影响和体系有关

作者
Author:
beidiwu    时间: 2017-4-21 07:00
非常感谢卢老师的回答,这样我心里就有底了。
ps: 我的博士课题偏实验,关于计算化学的知识都来自在这个论坛,qq群,还有卢老师的培训班。
这些知识虽然学的不深,但对我的论文课题帮助很大,再次向卢老师表示敬意和感谢!
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ggdh    时间: 2017-4-21 16:32
用state-specific 算算 一般会增大eps差异。具体做法参考sob的那篇博文
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冰释之川    时间: 2017-4-21 16:55
ggdh 发表于 2017-4-21 16:32
用state-specific 算算 一般会增大eps差异。具体做法参考sob的那篇博文

用SS算虽然比LR更准但很耗时间,而且一次只能对一个激发态来做,如果要绘制完整的光谱,我看很费时。如果要精确研究某个激发态,用SS不错。
作者
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sobereva    时间: 2017-4-22 08:16
冰释之川 发表于 2017-4-21 16:55
用SS算虽然比LR更准但很耗时间,而且一次只能对一个激发态来做,如果要绘制完整的光谱,我看很费时。如果 ...


以后可尝试写个脚本,自动对每个振子强度大于指定阈值的态做cLR(比SS便宜太多,而且结果不比它差多少),然后把结果提出来,并与其余次要态的LR结果合并,汇总成Multiwfn可以读的文本文件格式,再展宽成UV-Vis。
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liy    时间: 2017-4-27 16:09
优化结构时不用在溶剂条件下进行优化么?
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sobereva    时间: 2017-4-30 20:13
liy 发表于 2017-4-27 16:09
优化结构时不用在溶剂条件下进行优化么?

对于中性体系溶剂对结构的影响通常不大,如果你要结果绝对可靠,优化时也带着溶剂模型,耗时会增加几分之一

作者
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kimariyb    时间: 2023-8-3 17:59
sobereva 发表于 2017-4-21 04:48
相差只有10nm已经算很不错了
关键词没有问题。不过为了和实验对比,还是最好用混合溶剂,怎么自定义这里写 ...

卢老师,学生最近在不同的溶剂下计算香豆素的 UV-VIS 光谱时遇到一个问题。如图所示,三种溶剂下计算到的 UV-VIS 光谱几乎都重叠在一起了,没有很明显的差距。学生该如何解决这一问题呢。学生的计算流程以及计算的关键词分别为:
1、先在 IEFPCM 溶剂模型下优化和振动分析,拿到无虚频的极小值结构。 # opt freq PBE1PBE/TZVP scrf(solvent= solv_name)solv_name 分别为 CH2Cl2、DMSO、Water

2、然后在 IEFPCM 溶剂模型下做激发态计算 # td(nstates=50) PBE1PBE/TZVP scrf(solvent= solv_name),solv_name 分别为 CH2Cl2、DMSO、Water


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sobereva    时间: 2023-8-3 18:11
kimariyb 发表于 2023-8-3 17:59
卢老师,学生最近在不同的溶剂下计算香豆素的 UV-VIS 光谱时遇到一个问题。如图所示,三种溶剂下计算到的 ...

说明此体系对溶剂就是不很敏感
对于特定激发态,如290nm左右的,若用cLR或特定态模型,可以得到更准确的描述
作者
Author:
kimariyb    时间: 2023-8-3 18:24
sobereva 发表于 2023-8-3 18:11
说明此体系对溶剂就是不很敏感
对于特定激发态,如290nm左右的,若用cLR或特定态模型,可以得到更准确的 ...

好的,感谢卢老师的回答




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