计算化学公社

标题: 求助:做蛋白-小分子复合物模拟前,Gaussian优化小分子时的关键词选择 [打印本页]

作者
Author:
crush    时间: 2025-10-29 10:04
标题: 求助:做蛋白-小分子复合物模拟前,Gaussian优化小分子时的关键词选择
我在做蛋白-小分子复合物在水中的动力学模拟,在做小分子拓扑时,想先使用Gaussian对小分子结构进行优化,然后交给Multiwfn计算RESP电荷,最后使用sobtop做小分子的拓扑。

本人是量子化学方面的新手,所以想请教一下各位老师:
1.我这个小分子的Gaussian的关键词是否合理?
2.sob老师推荐 以溶剂环境下的非可极化力场的分子动力学模拟为目的,RESP2(0.5)电荷更合适。如果cpu资源紧张,想快速计算RESP电荷的话,仅计算隐式溶剂模型下的RESP电荷跑MD是否也能接受?
在此之前已经参考过sob老师的两篇教程 1. http://sobereva.com/441   2. http://sobereva.com/531

(, 下载次数 Times of downloads: 2)
作者
Author:
sobereva    时间: 2025-10-30 08:51
1 合理
2 可以。但根本省不了多少时间
作者
Author:
crush    时间: 2025-10-30 09:37
sobereva 发表于 2025-10-30 08:51
1 合理
2 可以。但根本省不了多少时间

好的,谢谢sob老师




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