计算化学公社

标题: ORCA分子动力学模块怎么结合xTB跑模拟? [打印本页]

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daisuwei    时间: 2025-10-29 18:19
标题: ORCA分子动力学模块怎么结合xTB跑模拟?
我是ORCA 6.1版本,在手册中分子动力学部分(https://www.faccts.de/docs/orca/ ... ynamics/moldyn.html)搜索xTB仅搜索到在ORCA 4.2版本中更新了MD中的xTB,没有检索到如何使用。在inp文件顶部输入! MD XTB后报错无法优化,请问大家怎么在MD模块中使用xTB呢,我是想参考这篇帖子http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html做构象搜索。



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wzkchem5    时间: 2025-10-29 18:35
应当查怎么做xTB的单点或梯度计算,以及怎么做MD计算,再把两部分关键词合并起来写。
手册不可能事无巨细地列举每两个功能同时用的时候关键词怎么写。在一章讲了怎么做xTB计算,另一章讲了怎么做MD计算,这就算手册尽到告知用户的义务了,如何把两者合并起来写是用户的事。
此外,遇到报错信息,必须自行分析报错信息的含义(当成做英语阅读理解题),往往通过报错信息就能知道哪里写错了
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daisuwei    时间: 2025-10-29 21:37
wzkchem5 发表于 2025-10-29 18:35
应当查怎么做xTB的单点或梯度计算,以及怎么做MD计算,再把两部分关键词合并起来写。
手册不可能事无巨细 ...

是的是的,我以为ORCA是直接内置了xTB的所有方法所以想当然了。查了3.5节(https://www.faccts.de/docs/orca/ ... /semiempirical.html)和https://xtb-docs.readthedocs.io/en/latest/setup.html才发现还需要手动改个otool_xtb,添加系统变量才可以使用,谢谢!
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sobereva    时间: 2025-10-30 09:06
daisuwei 发表于 2025-10-29 21:37
是的是的,我以为ORCA是直接内置了xTB的所有方法所以想当然了。查了3.5节(https://www.faccts.de/docs/o ...

ORCA 6.1开始本来就是直接内置了GFN-xTB方法,都不需要调用外部程序

北京科音高级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KAQC)里我还专门讲了:
(, 下载次数 Times of downloads: 4)

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daisuwei    时间: 2025-10-30 11:00
sobereva 发表于 2025-10-30 09:06
ORCA 6.1开始本来就是直接内置了GFN-xTB方法,都不需要调用外部程序

北京科音高级量子化学培训班(htt ...

sob老师好,我想仿照您用http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html中的GFN0-xTB做构象搜索,之前我试过只写关键词XTB是采用的GFN2-xTB,好像是GFN0是没有内置的,我昨天加了一个系统变量才可以使用
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sobereva    时间: 2025-10-31 05:51
daisuwei 发表于 2025-10-30 11:00
sob老师好,我想仿照您用http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html中的GFN0-xTB做构象搜索,之前我 ...

我的帖子里明明是xtb直接跑的动力学,而不是靠ORCA来调用
跑GFN-xTB的动力学用ORCA比起xtb直接跑慢得多。你的行为十分莫名其妙

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Daniel_Arndt    时间: 2025-10-31 10:03
daisuwei 发表于 2025-10-29 21:37
是的是的,我以为ORCA是直接内置了xTB的所有方法所以想当然了。查了3.5节(https://www.faccts.de/docs/o ...

你看一下 https://www.faccts.de/docs/orca/ ... _steps/install.html 就知道,ORCA 6.0.0需要手动安装xtb到特定位置并改名为otool_xtb,ORCA 6.0.1和ORCA 6.1.0都已经自带了xtb。但你如果是想要做构象搜索的话,要么直接通过crest调用xtb,这种做法压根牵扯不到ORCA,要么就用ORCA 6引入的GOAT功能( https://doi.org/10.1002/anie.202500393 )。




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