计算化学公社

标题: TED(total energy distribution)的计算软件问题？ [打印本页]

作者
Author: zhyho00824 时间: 2017-4-24 17:01
标题: TED(total energy distribution)的计算软件问题？
TED的计算看了很多资料都是用PQS做的，但是这个软件的试用版只能算不超过25个原子的体系，不知道有没有其他可替代的软件。我主要是用来对振动光谱进行指认的，之前有用过PED方法，用的是开源的VEDA软件，算的是7分子簇的，发现这种方法在低频区间（低于100个波数）的振动指认和GV看到的不符，所以想用其他的方法看一下。

作者
Author: sobereva 时间: 2017-4-25 10:25
做PED分析的一些程序Molvib,GAR2PED,VEDA,fcart01...
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=276

Gaussian中分析振动模式成份的关键词freq=intmodes
http://sobereva.com/106

作者
Author: zhyho00824 时间: 2017-4-27 10:57
多谢，我用gar2ped做了相应的分析，对象有56个原子的分子簇，一共有162种振动模式，发现那些振动的定义我不是狠明白，伸缩不用管直接1，enter就行，2 torsion基本可以理解 3,4基本和甲基有关的，5连在C上的双键其他两个对称 6 双键其他两个不对称 7 。。8 氨基的变形 9 亚氨基的变形 10,11,12 4，5,6元环 13 OH 弯曲 X-O-H 我研究对象分子之间有氢键，C=0~~H-N ，是否需要设定这个模式呢？ 1,4,15,16，17 和环有关系的 18 spiro-atom 螺旋原子 19 线性弯曲这个功能不明白要输入4个原子的序号ABCD= ,解释是bends in and perpendicular to A-C-D plane 面内和垂直于面的弯曲？由于gar2ped的例程太少了，就是参照您的帖子来学习的，有很多疑惑都不知道怎么去解决。

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