计算化学公社

标题: vmd无法加载IGMH的cub文件求助 [打印本页]

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科研小白0126    时间: 2025-11-11 15:50
标题: vmd无法加载IGMH的cub文件求助
各位老师,我在进行IGMH计算时,我的分子原子总数在500左右,格点我用的0.15,0.15.,015,算完文件较大,用source IGM_inter.vmd命令时,vmd出现这种情况,这是我内存问题吗,希望有老师能给予指导,万分感谢

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pal    时间: 2025-11-11 16:14
大概是内存爆了
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SharkYYX2025    时间: 2025-11-11 16:30
内存不够,VMD到2GB就不行了。可以考虑换64位版本。站内搜索VMD  64有一些帖子,比如这个
原生Windows平台vmd1.9.3 x64版本 - 资源分享 - 计算化学公社  http://bbs.keinsci.com/forum.php ... ;highlight=VMD%2B64
Windows版本vmd1.9.4 cuda x64测试版 - 资源分享 - 计算化学公社  http://bbs.keinsci.com/forum.php ... ;highlight=VMD%2B64
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科研小白0126    时间: 2025-11-11 17:07
SharkYYX2025 发表于 2025-11-11 16:30
内存不够,VMD到2GB就不行了。可以考虑换64位版本。站内搜索VMD  64有一些帖子,比如这个
原生Windows平台 ...

好的感谢老师,降低精度(格点)是不是也可以算一种方法
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SharkYYX2025    时间: 2025-11-11 23:18
本帖最后由 SharkYYX2025 于 2025-11-11 23:23 编辑
科研小白0126 发表于 2025-11-11 17:07
好的感谢老师,降低精度(格点)是不是也可以算一种方法

我觉得可以试试。但是这样有可能等值面不太清晰,比较毛糙不美观。不影响观看是可以接受的,在你目标区域反映出相互作用的大概位点,然后边缘细节可能看不清。下文的10有介绍
谈谈与计算化学有关的作图的图像清晰问题 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元  http://sobereva.com/607





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