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标题: 溶液/溶质分子的力场与主top中Include的力场冲突 [打印本页]

作者
Author: Wxh18130507355 时间: 2025-11-12 16:06
标题: 溶液/溶质分子的力场与主top中Include的力场冲突
sob老师及各位大佬，我的电解液体系包含有有机分子及锂盐分子，都是通过sobtop基于GAFF力场产生的itp文件，但是我通过北京科音分子动力学与gromacs程序培训班讲义了解到对于电解液体系使用KBFF力场更好（此处有个小疑问，对电解液体系是使用KBFF更好还是KBFF20更好？），现在我使用的Li.itp是基于KBFF20力场的，而2255THF.itp、No3-.itp、F2No4S2-.itp是基于GAFF的，那我在主top文件里Include"kbff20.ff/forcefield.itp",这会不会与GAFF冲突！之前我使用的是amber99sb-ildn.ff/forcefield.itp力场，但是效果不佳，现在我想试试KBFF力场，那我现在应该如何做来避免这个冲突呢？恳请sob老师及各位大佬解答一下！
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作者
Author: sobereva 时间: 2025-11-13 01:49
KBFF的comb-rule跟AMBER/GAFF不一样，没法混用
可以尝试Merz的Li+的参数

作者
Author: Wxh18130507355 时间: 2025-11-13 10:12

sobereva 发表于 2025-11-13 01:49
KBFF的comb-rule跟AMBER/GAFF不一样，没法混用
可以尝试Merz的Li+的参数

好滴sob老师，那我的其他的溶质/溶剂分子，还包括主top中Include的力场全都不变是吗，只用将锂离子的参数换为Merz的是嘛

作者
Author: sobereva 时间: 2025-11-13 23:09

Wxh18130507355 发表于 2025-11-13 10:12
好滴sob老师，那我的其他的溶质/溶剂分子，还包括主top中Include的力场全都不变是吗，只用将锂离子的参数 ...

include AMBER的forcefield.itp

作者
Author: Wxh18130507355 时间: 2025-11-20 10:37

sobereva 发表于 2025-11-13 23:09
include AMBER的forcefield.itp

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老师，您看下是这样的对吧

作者
Author: sobereva 时间: 2025-11-21 03:36

Wxh18130507355 发表于 2025-11-20 10:37
老师，您看下是这样的对吧

这明明是KBFF目录下的forcefield.itp

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