计算化学公社

标题: 大家可以帮我分析一下我这个化合物C-S不能成键吗？ [打印本页]

作者
Author: ymeng 时间: 2025-11-12 22:12
标题: 大家可以帮我分析一下我这个化合物C-S不能成键吗？
计算细节：#p opt freq b3lyp/6-311g(d,p) empiricaldispersion=gd3bj
但是C-S距离始终在1.9左右，按道理来说应该形成一个四配位的C连接的结构，这个c-s键长的距离始终偏长，还是说这个化合物的结构本身也有问题，求指点

作者
Author: KazusaT 时间: 2025-11-12 22:51
1.9A还好吧，C-S单键的话巯基乙醇应该是1.8A左右，并且感觉这里还有一个芳环pi电子对C-S sigma*的填充

作者
Author: ymeng 时间: 2025-11-13 00:59

KazusaT 发表于 2025-11-12 22:51
1.9A还好吧，C-S单键的话巯基乙醇应该是1.8A左右，并且感觉这里还有一个芳环pi电子对C-S sigma*的填充

总感觉1.9的S-C键不是很有说服力，这个键长导致如果1.85我都可以接受，我实在是不能做到更小了，那就这样

作者
Author: sobereva 时间: 2025-11-13 01:22
恰当计算级别算出来是什么样就是什么样，还不放心的话可以再用wB97XD/def2-TZVP算一下
硫的半径大，1.9埃不意味着有什么问题，而标题里说“不能成键”更是夸大其词，看下文
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414（http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html）

作者
Author: KazusaT 时间: 2025-11-13 01:51

ymeng 发表于 2025-11-13 00:59
总感觉1.9的S-C键不是很有说服力，这个键长导致如果1.85我都可以接受，我实在是不能做到更小了，那就这样 ...

同意sob老师，不过如果有人质疑的话感觉从键级和电子结构上分析也很容易说明，总之感觉这里1.9A是很合理的结果

作者
Author: pal 时间: 2025-11-13 09:03
这里会不会是右边的N过于平面导致的

作者
Author: SharkYYX2025 时间: 2025-11-13 13:46
1.9是略长了一点。我看我五元芳环化合物的C-S键长是1.74，你这个五元环没有芳香性，可能是键长大些。gview判断C-S单键1.88，所以我觉得还好
有可能是右边那个N-N上面富电子（类似于吡啶位N原子，有孤对电子），把S排斥开了，所以C-S键长增加
(, 下载次数 Times of downloads: 0)

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)