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标题: 自由基，有机物和过渡金属存在的体系泛函该怎么选择？ [打印本页]

作者
Author: zyhhh 时间: 2025-11-14 16:32
标题: 自由基，有机物和过渡金属存在的体系泛函该怎么选择？
本帖最后由 zyhhh 于 2025-11-14 17:43 编辑

1：之前算自由基和有机物存在的吉布斯自由能一直选择的是M062X泛函，但是在后面自由基和过渡金属存在的体系中，计算能量是采用PWPB95-D3(BJ)吗？
2：用上述这个函数这样输入是否正确：# opt freq PWPB95/def2svp scrf=(smd,solvent=water) geom=connectivity
EmpiricalDispersion=GD3
3：在网上找到的结构用ms打开后想转成mol结构需要去除周期性，但去除周期性后原子数增多。于是直接用cif文件在高斯中打开但文末出现了Tv这个元素，网上查询发现是否删除要看进不进行PBC计算，请问我这个能量计算需要保留还是删除呢

4:计算的这个过渡金属是固体但泡在溶液中还是跟之前一样考虑溶剂效应吗

作者
Author: sobereva 时间: 2025-11-15 07:05
1 没理由非得用PWPB95-D3(BJ)不可。并且描述要准确，说具体是计算自由能的哪一步，opt freq和算电子能量的级别通常有极大不同。
仔细看此文
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272（http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html）

2 这叫关键词，不叫函数
Gaussian根本不支持PWPB95，ORCA等程序才有

3 你当单分子计算而不当晶体计算当然得去掉Tv

4 固体体相中的单分子又不可能接触溶剂。搞清楚算的是什么东西、计算的实际目的何在

作者
Author: zyhhh 时间: 2025-11-15 14:25

sobereva 发表于 2025-11-15 07:05
1 没理由非得用PWPB95-D3(BJ)不可。并且描述要准确，说具体是计算自由能的哪一步，opt freq和算电子能量的 ...

好的感谢sob老师

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