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标题: 求助如何判定自己的模拟是否结束 [打印本页]

作者
Author: Jnannan 时间: 2025-11-15 22:10
标题: 求助如何判定自己的模拟是否结束
各位前辈好，我现在进行了蛋白质相变分散相的模拟，如何判断我的模拟不需要往下进行。这是我的RMSD值，我不太会看，请各位前辈指教。这两个区别怎么那么大呀。

作者
Author: student0618 时间: 2025-11-15 22:35
模拟目的是什么？不同目的要观察的都不同。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-11-16 05:51
先把此文看了，若还有问题，结合楼上的提示补充必要的信息
谈谈怎么判断分子动力学模拟是否达到了平衡
http://sobereva.com/627（http://bbs.keinsci.com/thread-27122-1-1.html）

作者
Author: Jnannan 时间: 2025-11-17 09:48

student0618 发表于 2025-11-15 22:35
模拟目的是什么？不同目的要观察的都不同。

前辈好，我的目的是看一下分散相整体结构40ns是否达到稳定，这样我好切换盐浓度进行凝聚相的模拟。我可能表述的不是很清楚，前辈您有问题还可以继续问

作者
Author: Jnannan 时间: 2025-11-17 09:54
还有一个问题就是这个图上三条不同颜色的线代表什么呀，那个稳定为准呀

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