计算化学公社

标题: vmd如何选择离某个残基较近的残基? [打印本页]

作者
Author:
kjxwl3    时间: 2017-4-26 16:58
标题: vmd如何选择离某个残基较近的残基?
各位vmd大神:
    向你们请教一下,如何在vmd里面选择离某个残基较近的残基:
    我的乙醇的残基名为MET,冠醚的残基CRO,我现在想选择里CRO残基较近的MET残基,我写的选择语句是:
    resname MET within 20 of resname CRO.
    结果报错,这个该怎么写?

作者
Author:
ruanyang    时间: 2017-4-26 19:36
resname MET and (within 20 of resname CRO)
没事多看手册

作者
Author:
kjxwl3    时间: 2017-4-30 20:43
ruanyang 发表于 2017-4-26 19:36
resname MET and (within 20 of resname CRO)
没事多看手册

我才用类似的方式选取残基,resname MOL and (within 10 of residue 0),得到的图很奇怪,感觉有几个乙醇分子都被分开了。附件是我的最后一帧的pdb,我创建的这个representation的图也在附件中。

作者
Author:
ruanyang    时间: 2017-5-1 08:57
same resid as XXX and (resname MET and (within 20 of resname CRO))




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